More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4538 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 710 aa  1414    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.99 
 
 		 910 aa  160  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.96 
 
 		 915 aa  152  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  34.72 
 
 		 1156 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  32.97 
 
 		 1033 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.68 
 
 		 1125 aa  147  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.71 
 
 		 1134 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.16 
 
 		 926 aa  144  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  35.09 
 
 		 942 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.41 
 
 		 906 aa  140  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  31.59 
 
 		 1154 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.46 
 
 		 913 aa  137  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  30.58 
 
 		 983 aa  137  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  34.06 
 
 		 991 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  32.66 
 
 		 1179 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.55 
 
 		 947 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  33.86 
 
 		 995 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  31.32 
 
 		 1028 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  34.11 
 
 		 1001 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.99 
 
 		 1006 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  30.63 
 
 		 1004 aa  130  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  30.7 
 
 		 909 aa  129  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  33.77 
 
 		 1001 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  30.08 
 
 		 974 aa  127  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  31.99 
 
 		 970 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  30.99 
 
 		 965 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.56 
 
 		 1454 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  31.06 
 
 		 949 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  28.12 
 
 		 1055 aa  125  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  30.06 
 
 		 998 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  30.6 
 
 		 954 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  29.75 
 
 		 970 aa  123  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  28.02 
 
 		 1038 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.4 
 
 		 710 aa  120  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  30.24 
 
 		 1446 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.74 
 
 		 392 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  32.69 
 
 		 298 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.97 
 
 		 577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  31.65 
 
 		 911 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.57 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.44 
 
 		 452 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.48 
 
 		 500 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.23 
 
 		 495 aa  114  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.05 
 
 		 298 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.72 
 
 		 682 aa  113  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  28.92 
 
 		 1121 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.09 
 
 		 396 aa  112  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.67 
 
 		 754 aa  110  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  33.7 
 
 		 399 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  30.74 
 
 		 644 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.14 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 		 1054 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.34 
 
 		 415 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.35 
 
 		 490 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  30.06 
 
 		 959 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.43 
 
 		 627 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  29.94 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.21 
 
 		 577 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  28.62 
 
 		 1175 aa  102  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.38 
 
 		 770 aa  100  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  31.61 
 
 		 1129 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  31.61 
 
 		 1129 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  31.61 
 
 		 1131 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  31.61 
 
 		 1131 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  31.61 
 
 		 1131 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  31.61 
 
 		 1131 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  31.61 
 
 		 1131 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  31.34 
 
 		 485 aa  99.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0755  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.77 
 
 		 679 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.312676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  30.33 
 
 		 576 aa  98.2  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0605  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.98 
 
 		 431 aa  97.8  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  29.75 
 
 		 692 aa  97.8  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.96 
 
 		 689 aa  97.4  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  31.37 
 
 		 339 aa  97.4  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.14 
 
 		 1085 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 		 688 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  30.61 
 
 		 315 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.92 
 
 		 597 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  30.56 
 
 		 316 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  30.56 
 
 		 316 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  29.87 
 
 		 315 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 		 316 aa  94.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  30.21 
 
 		 316 aa  94.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.9 
 
 		 325 aa  94.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  28.87 
 
 		 1315 aa  94.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.42 
 
 		 449 aa  94  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  30.21 
 
 		 316 aa  93.6  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  30.21 
 
 		 316 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  30.21 
 
 		 316 aa  93.6  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  30.21 
 
 		 316 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1770  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.49 
 
 		 527 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  32.21 
 
 		 1130 aa  93.2  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.03 
 
 		 627 aa  92  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 465 aa  92.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3547  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.29 
 
 		 556 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.96 
 
 		 718 aa  91.7  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.1 
 
 		 370 aa  91.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.39 
 
 		 594 aa  91.3  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 		 882 aa  90.9  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>