286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1004 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  72.69 
 
 		 970 aa  1296    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  50.94 
 
 		 942 aa  823    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  94.48 
 
 		 965 aa  1729    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 909 aa  1831    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  73.22 
 
 		 970 aa  1293    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  72.8 
 
 		 998 aa  1306    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  73.16 
 
 		 949 aa  1284    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  41.59 
 
 		 947 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.44 
 
 		 926 aa  286  9e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.35 
 
 		 915 aa  280  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  30.57 
 
 		 959 aa  271  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.99 
 
 		 910 aa  269  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.97 
 
 		 906 aa  265  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.16 
 
 		 913 aa  261  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.32 
 
 		 979 aa  225  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  29.36 
 
 		 911 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.87 
 
 		 954 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  30.4 
 
 		 974 aa  177  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.04 
 
 		 1004 aa  166  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.79 
 
 		 1125 aa  161  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.68 
 
 		 1055 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.87 
 
 		 1033 aa  157  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26.58 
 
 		 1038 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  26.61 
 
 		 1028 aa  154  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.45 
 
 		 991 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  25.15 
 
 		 1006 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.64 
 
 		 995 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.47 
 
 		 1134 aa  131  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 1154 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.56 
 
 		 983 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.99 
 
 		 710 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  24.43 
 
 		 1179 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  28.54 
 
 		 1446 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  24.29 
 
 		 1156 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  41.59 
 
 		 1325 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  28.53 
 
 		 1001 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  28.72 
 
 		 1001 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.45 
 
 		 816 aa  95.9  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  29.44 
 
 		 1175 aa  93.2  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  26.97 
 
 		 1121 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  34.44 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  28.27 
 
 		 1119 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.41 
 
 		 1285 aa  82.8  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.2 
 
 		 1177 aa  83.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  26.38 
 
 		 1782 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.02 
 
 		 754 aa  82  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.92 
 
 		 1011 aa  81.6  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  38.35 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  26.54 
 
 		 1041 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  26.54 
 
 		 1041 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  35.15 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  34.62 
 
 		 652 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.55 
 
 		 661 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.83 
 
 		 718 aa  77  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  34.6 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  35.07 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  35.07 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.97 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  25.9 
 
 		 995 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 		 848 aa  73.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2753  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.91 
 
 		 760 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.874894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.04 
 
 		 1848 aa  73.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 770 aa  73.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.29 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.97 
 
 		 634 aa  72  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.3 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.82 
 
 		 1322 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.66 
 
 		 1081 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.24 
 
 		 1532 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.52 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.53 
 
 		 972 aa  70.1  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  33.05 
 
 		 1459 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.35 
 
 		 919 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.65 
 
 		 1489 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  28.01 
 
 		 1180 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 		 1011 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  31.19 
 
 		 986 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  27.21 
 
 		 882 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.91 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  32.46 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  26.88 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.23 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46872  predicted protein  50 
 
 		 670 aa  64.7  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  28.86 
 
 		 1508 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  26.5 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  25.46 
 
 		 2711 aa  64.3  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  24.58 
 
 		 1129 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2457  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 		 678 aa  63.9  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.97 
 
 		 626 aa  63.9  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  25.87 
 
 		 576 aa  63.9  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  24.58 
 
 		 1131 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  24.58 
 
 		 1131 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 		 533 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.377717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  24.58 
 
 		 1131 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  24.77 
 
 		 1129 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.95 
 
 		 1029 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  24.58 
 
 		 1131 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  29.58 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.87 
 
 		 398 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.19 
 
 		 1066 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>