114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6700 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  71.78 
 
 
657 aa  937    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  99.85 
 
 
653 aa  1303    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  89.89 
 
 
652 aa  1147    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 
653 aa  1305    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  59.4 
 
 
683 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  98.47 
 
 
653 aa  1287    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  90.05 
 
 
652 aa  1146    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  71.1 
 
 
661 aa  908    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  52.09 
 
 
634 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  51.94 
 
 
641 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  50.59 
 
 
634 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  68.48 
 
 
348 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  47.17 
 
 
986 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  47.88 
 
 
995 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  50 
 
 
1053 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.52 
 
 
1011 aa  276  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  48.08 
 
 
1177 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  33.86 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  33.86 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  33.46 
 
 
423 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.4 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.66 
 
 
425 aa  114  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.44 
 
 
431 aa  107  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.89 
 
 
465 aa  103  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.8 
 
 
378 aa  97.8  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.2 
 
 
378 aa  97.1  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.84 
 
 
510 aa  89  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.94 
 
 
1125 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  38.73 
 
 
974 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  37.5 
 
 
949 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  37.5 
 
 
998 aa  82.4  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
970 aa  82.4  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
970 aa  82.4  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  39.69 
 
 
954 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.88 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  35.07 
 
 
965 aa  76.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  31.62 
 
 
1028 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.34 
 
 
947 aa  75.1  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  35.07 
 
 
909 aa  74.7  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  30.59 
 
 
1055 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  31.18 
 
 
1004 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  32.93 
 
 
1038 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.34 
 
 
906 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.5 
 
 
913 aa  64.3  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.83 
 
 
910 aa  63.9  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  34.12 
 
 
942 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2218  hypothetical protein  32.52 
 
 
709 aa  60.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.5 
 
 
915 aa  60.8  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  32.69 
 
 
1033 aa  60.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  44.83 
 
 
1062 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  38.1 
 
 
1325 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.91 
 
 
926 aa  59.7  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  37.19 
 
 
1006 aa  58.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  33.01 
 
 
250 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  37.72 
 
 
1530 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  33.01 
 
 
250 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  33 
 
 
250 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  36.03 
 
 
1446 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  33 
 
 
250 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  35.12 
 
 
1971 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  28.47 
 
 
258 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.82 
 
 
1532 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  27.56 
 
 
246 aa  55.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  32 
 
 
250 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  47.37 
 
 
3322 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  30.89 
 
 
285 aa  54.7  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  29.46 
 
 
287 aa  54.3  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  33.64 
 
 
275 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.56 
 
 
1806 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  50.85 
 
 
2906 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  35.05 
 
 
2057 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  34.44 
 
 
241 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  37.96 
 
 
1882 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  27.86 
 
 
253 aa  52  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  29.59 
 
 
422 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  39.25 
 
 
2396 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  39.16 
 
 
1632 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.63 
 
 
256 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  32.29 
 
 
283 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  28.43 
 
 
248 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  32.22 
 
 
241 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  41.89 
 
 
2578 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  43.48 
 
 
2711 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  40.96 
 
 
2346 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  40.96 
 
 
2365 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  27.19 
 
 
249 aa  48.9  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  40.57 
 
 
994 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  35.62 
 
 
289 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  32.93 
 
 
1108 aa  47.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  49.28 
 
 
861 aa  47.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  44.44 
 
 
2642 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  53.7 
 
 
1029 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 
1741 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  52.63 
 
 
2926 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  35.85 
 
 
4238 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  26.8 
 
 
279 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.65 
 
 
1055 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  46.03 
 
 
2407 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  28.33 
 
 
253 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>