203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2325 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1782 aa  3386    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  51.47 
 
 		 1333 aa  508  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  38.28 
 
 		 1119 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  36.95 
 
 		 2711 aa  452  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1881 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  31.87 
 
 		 2003 aa  421  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  37.15 
 
 		 1550 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  35.82 
 
 		 2396 aa  373  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  34.86 
 
 		 2371 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.31 
 
 		 1029 aa  357  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  33.25 
 
 		 2366 aa  353  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  32.73 
 
 		 1508 aa  352  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  35.57 
 
 		 2365 aa  336  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  35.57 
 
 		 2346 aa  335  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  35.99 
 
 		 995 aa  324  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.2 
 
 		 1227 aa  320  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.64 
 
 		 3506 aa  319  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.36 
 
 		 1011 aa  318  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  35.19 
 
 		 986 aa  318  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.27 
 
 		 1848 aa  308  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  35.99 
 
 		 2906 aa  301  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  36.31 
 
 		 1971 aa  299  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  31.95 
 
 		 1519 aa  284  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  33.85 
 
 		 3322 aa  270  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  32.14 
 
 		 3954 aa  267  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  30.95 
 
 		 4238 aa  262  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  33.22 
 
 		 650 aa  260  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  31.13 
 
 		 3822 aa  261  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  34.04 
 
 		 1001 aa  259  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  35.98 
 
 		 995 aa  258  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.6 
 
 		 972 aa  258  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  32.14 
 
 		 4238 aa  258  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.07 
 
 		 1285 aa  254  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  33.16 
 
 		 1001 aa  250  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  35.27 
 
 		 991 aa  250  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  29.13 
 
 		 990 aa  248  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.71 
 
 		 919 aa  246  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  37.44 
 
 		 1053 aa  245  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  33.64 
 
 		 1530 aa  237  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  33.39 
 
 		 983 aa  236  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.88 
 
 		 1532 aa  228  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  32.64 
 
 		 1028 aa  227  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  32.75 
 
 		 1033 aa  219  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  29.55 
 
 		 1056 aa  217  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  32.08 
 
 		 1004 aa  218  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  31.66 
 
 		 1164 aa  218  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  31.98 
 
 		 1129 aa  214  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  31.98 
 
 		 1131 aa  214  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  31.98 
 
 		 1131 aa  214  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  31.98 
 
 		 1131 aa  214  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  35.09 
 
 		 1062 aa  214  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  31.83 
 
 		 1129 aa  212  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.21 
 
 		 1055 aa  212  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  31.83 
 
 		 1131 aa  212  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  31.42 
 
 		 1130 aa  209  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  33.76 
 
 		 677 aa  208  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  31.08 
 
 		 985 aa  207  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.76 
 
 		 3629 aa  204  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  33.6 
 
 		 1016 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  31.21 
 
 		 1038 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  31.83 
 
 		 1131 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.81 
 
 		 2578 aa  197  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.48 
 
 		 1081 aa  196  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.36 
 
 		 1125 aa  186  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  29.04 
 
 		 994 aa  182  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 		 1006 aa  177  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  29.81 
 
 		 1459 aa  176  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  29.98 
 
 		 1458 aa  174  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  31.75 
 
 		 816 aa  173  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  30.77 
 
 		 1011 aa  166  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  29.57 
 
 		 980 aa  165  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  27.69 
 
 		 2407 aa  160  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  33.79 
 
 		 2057 aa  157  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  29.46 
 
 		 1111 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  41.27 
 
 		 1113 aa  153  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.19 
 
 		 1322 aa  152  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  29.5 
 
 		 1180 aa  149  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  30.94 
 
 		 1152 aa  149  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 		 1769 aa  148  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  30.77 
 
 		 994 aa  142  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  29.53 
 
 		 814 aa  134  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.93 
 
 		 1489 aa  132  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  36.99 
 
 		 2926 aa  132  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.76 
 
 		 3420 aa  130  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  30.09 
 
 		 882 aa  130  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  27.2 
 
 		 1078 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  30.64 
 
 		 3391 aa  126  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  32.1 
 
 		 1130 aa  121  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.93 
 
 		 1177 aa  118  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1882 aa  113  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1325 aa  113  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  27.5 
 
 		 1019 aa  112  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.94 
 
 		 1741 aa  105  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  29.45 
 
 		 972 aa  105  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.71 
 
 		 926 aa  105  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  30.88 
 
 		 1172 aa  105  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  42.22 
 
 		 3415 aa  101  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  46.15 
 
 		 852 aa  100  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  34.92 
 
 		 1861 aa  100  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  35.74 
 
 		 1571 aa  98.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>