113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4035 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  100 
 
 		 994 aa  1937    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  39.14 
 
 		 2906 aa  217  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  40.45 
 
 		 2578 aa  191  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  39.84 
 
 		 2642 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.2 
 
 		 3391 aa  136  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  28.84 
 
 		 1550 aa  128  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  42.11 
 
 		 2926 aa  127  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.81 
 
 		 3089 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  31.15 
 
 		 1325 aa  125  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.98 
 
 		 1446 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  36.02 
 
 		 1113 aa  120  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.68 
 
 		 2363 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  27 
 
 		 1881 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  31.07 
 
 		 3506 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  28.33 
 
 		 1119 aa  112  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 		 1154 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.36 
 
 		 1227 aa  108  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  32.6 
 
 		 1156 aa  108  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  35.14 
 
 		 2711 aa  107  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  41.39 
 
 		 2407 aa  105  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.45 
 
 		 1532 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.67 
 
 		 1134 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  41.55 
 
 		 1571 aa  102  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  30.02 
 
 		 1179 aa  102  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  32.29 
 
 		 2396 aa  100  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  34.67 
 
 		 3415 aa  97.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  34.67 
 
 		 3420 aa  96.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  30.41 
 
 		 1782 aa  95.9  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  34.13 
 
 		 2366 aa  94.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.18 
 
 		 3629 aa  93.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  32.31 
 
 		 1180 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  31.88 
 
 		 2003 aa  91.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  30.08 
 
 		 3322 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  33.51 
 
 		 1971 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  26.36 
 
 		 1508 aa  89  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.3 
 
 		 1806 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1632 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  32.39 
 
 		 2365 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  32.39 
 
 		 2346 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  41.18 
 
 		 1078 aa  86.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1300 aa  86.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 1861 aa  85.9  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.3 
 
 		 1848 aa  84  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1530 aa  82.8  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 816 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  36.29 
 
 		 3822 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  33.92 
 
 		 2371 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  33.18 
 
 		 1115 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.89 
 
 		 1011 aa  75.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  36.16 
 
 		 1099 aa  74.7  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 		 1459 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.06 
 
 		 861 aa  73.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  31.83 
 
 		 1882 aa  72.4  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  34.02 
 
 		 4238 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  31.34 
 
 		 2057 aa  72  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.9 
 
 		 1029 aa  71.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  36 
 
 		 4238 aa  71.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.75 
 
 		 1357 aa  70.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.04 
 
 		 1093 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.04 
 
 		 1093 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  34.3 
 
 		 1108 aa  68.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.89 
 
 		 1004 aa  68.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  32.82 
 
 		 3954 aa  68.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  31.03 
 
 		 852 aa  67.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.61 
 
 		 1033 aa  67  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.92 
 
 		 1285 aa  64.7  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  29.79 
 
 		 1593 aa  64.3  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  27.21 
 
 		 1055 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  33.49 
 
 		 1111 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  33.78 
 
 		 1172 aa  60.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.21 
 
 		 3015 aa  60.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 		 1458 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  24.89 
 
 		 991 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  28.41 
 
 		 3504 aa  57.4  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  28.19 
 
 		 1130 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1165 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1165 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.35 
 
 		 995 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  27.95 
 
 		 1254 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.22 
 
 		 1081 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  32.87 
 
 		 1068 aa  55.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.82 
 
 		 661 aa  55.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  39.37 
 
 		 986 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  29.82 
 
 		 950 aa  53.9  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  25.42 
 
 		 1028 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  33.7 
 
 		 1019 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  29.29 
 
 		 1441 aa  52.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  28.86 
 
 		 1250 aa  52  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  29.03 
 
 		 1250 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.9 
 
 		 2847 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.57 
 
 		 1234 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  30.14 
 
 		 1252 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  30.57 
 
 		 1234 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  38.58 
 
 		 995 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.86 
 
 		 1741 aa  48.9  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  29.11 
 
 		 1234 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  25.49 
 
 		 1038 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  40.57 
 
 		 653 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  40.57 
 
 		 653 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  38.89 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>