191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1148 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  100 
 
 
3420 aa  6527    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  51.06 
 
 
2926 aa  872    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  47.4 
 
 
1571 aa  810    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  99.42 
 
 
3415 aa  6139    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  46.7 
 
 
852 aa  569  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  47.99 
 
 
1068 aa  526  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  53.35 
 
 
1012 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  44.72 
 
 
950 aa  489  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  41.63 
 
 
1108 aa  442  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  41.44 
 
 
1113 aa  434  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  41.58 
 
 
2906 aa  430  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  42.71 
 
 
1593 aa  425  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  44.08 
 
 
2578 aa  424  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  44.25 
 
 
1861 aa  416  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  39.97 
 
 
1268 aa  357  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  43.59 
 
 
1259 aa  353  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  43.59 
 
 
1285 aa  353  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  43.59 
 
 
1269 aa  351  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  43.38 
 
 
1254 aa  349  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  38.44 
 
 
1550 aa  290  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  40.91 
 
 
861 aa  238  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  32.24 
 
 
3506 aa  233  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  30.55 
 
 
1115 aa  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30.91 
 
 
1741 aa  177  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  30.16 
 
 
4391 aa  174  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  30.24 
 
 
1093 aa  170  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  30.24 
 
 
1093 aa  170  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  31.65 
 
 
1040 aa  170  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  29.39 
 
 
4312 aa  168  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.53 
 
 
2711 aa  163  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  32.76 
 
 
1882 aa  158  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.18 
 
 
1099 aa  155  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  35.06 
 
 
1881 aa  154  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 
1594 aa  153  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  28.87 
 
 
1327 aa  152  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  29.96 
 
 
1971 aa  152  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  35.71 
 
 
3391 aa  152  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  28.87 
 
 
1349 aa  152  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  28.87 
 
 
1327 aa  151  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  29.94 
 
 
1806 aa  150  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.51 
 
 
1023 aa  149  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.94 
 
 
947 aa  146  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  29.98 
 
 
1579 aa  145  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.98 
 
 
1357 aa  145  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  44.03 
 
 
2363 aa  143  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  29.41 
 
 
1165 aa  141  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  29.41 
 
 
1165 aa  141  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  29.69 
 
 
2637 aa  140  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.48 
 
 
1327 aa  139  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.43 
 
 
818 aa  133  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.81 
 
 
825 aa  132  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  30.4 
 
 
2642 aa  132  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  29.13 
 
 
989 aa  132  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  27.17 
 
 
2057 aa  130  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.63 
 
 
819 aa  129  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.76 
 
 
1762 aa  129  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 
1762 aa  129  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  30.22 
 
 
1067 aa  129  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  46.5 
 
 
1119 aa  128  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.14 
 
 
1055 aa  128  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.7 
 
 
1763 aa  127  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  29.02 
 
 
773 aa  121  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  31.55 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.23 
 
 
1770 aa  121  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  28.32 
 
 
1753 aa  121  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  28.74 
 
 
1530 aa  121  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  29.74 
 
 
1070 aa  120  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  30.41 
 
 
1070 aa  119  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.98 
 
 
1748 aa  119  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.43 
 
 
868 aa  117  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  32.75 
 
 
1458 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  30.63 
 
 
1626 aa  114  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  32.58 
 
 
1782 aa  112  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  36.64 
 
 
2003 aa  111  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  34.67 
 
 
994 aa  110  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.39 
 
 
1081 aa  108  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  31.86 
 
 
1459 aa  107  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  45.74 
 
 
1508 aa  106  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.47 
 
 
1532 aa  102  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  39.84 
 
 
2365 aa  101  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  39.84 
 
 
2346 aa  102  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  33.92 
 
 
1111 aa  100  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.69 
 
 
1029 aa  99.8  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  44.33 
 
 
2396 aa  99  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  24.51 
 
 
1102 aa  99  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.67 
 
 
924 aa  97.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.02 
 
 
1227 aa  95.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  43.88 
 
 
2371 aa  95.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.6 
 
 
806 aa  94.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  43.46 
 
 
2366 aa  92.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.82 
 
 
3629 aa  92.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.12 
 
 
1322 aa  92  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.09 
 
 
820 aa  90.9  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.59 
 
 
1277 aa  90.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  35.44 
 
 
1130 aa  90.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  43.07 
 
 
955 aa  88.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.64 
 
 
1234 aa  88.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  43.55 
 
 
955 aa  87.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  31.48 
 
 
860 aa  86.7  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  39.22 
 
 
1180 aa  86.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>