108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3513 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  83.52 
 
 
1259 aa  2072    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  79.84 
 
 
1259 aa  1961    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  78.9 
 
 
1285 aa  1952    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1268 aa  2507    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  82.33 
 
 
1254 aa  2036    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  80.2 
 
 
1269 aa  1959    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  41.89 
 
 
1012 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  45.58 
 
 
950 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  43.6 
 
 
1108 aa  364  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  37.88 
 
 
1571 aa  349  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  39.97 
 
 
3415 aa  347  8e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  39.97 
 
 
3420 aa  345  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  41.61 
 
 
2926 aa  346  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  40.92 
 
 
2578 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  40.92 
 
 
2906 aa  342  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  40.92 
 
 
1861 aa  341  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  35.53 
 
 
1113 aa  323  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  33.38 
 
 
1068 aa  308  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  39.18 
 
 
1593 aa  303  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  39.1 
 
 
861 aa  154  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  31.33 
 
 
1349 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  30.08 
 
 
1327 aa  139  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  31.33 
 
 
1327 aa  139  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 
1099 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  28.6 
 
 
1806 aa  121  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.14 
 
 
1327 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  28.38 
 
 
989 aa  115  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  30.13 
 
 
773 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.83 
 
 
947 aa  112  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.31 
 
 
1040 aa  112  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  30.21 
 
 
1067 aa  110  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  29.82 
 
 
466 aa  109  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  29.05 
 
 
1762 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  29.05 
 
 
1762 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  29.73 
 
 
1070 aa  107  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.36 
 
 
1165 aa  107  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  28.61 
 
 
4391 aa  106  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.63 
 
 
1748 aa  107  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.36 
 
 
1165 aa  107  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.99 
 
 
1763 aa  107  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  28.05 
 
 
1753 aa  105  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  29.43 
 
 
1070 aa  105  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  28.61 
 
 
4312 aa  105  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  26.85 
 
 
1093 aa  104  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.25 
 
 
1770 aa  104  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  26.85 
 
 
1093 aa  104  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  27.72 
 
 
1594 aa  103  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.36 
 
 
1115 aa  102  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  27.36 
 
 
1102 aa  102  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  26.87 
 
 
1579 aa  101  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.65 
 
 
1770 aa  101  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  30.1 
 
 
2637 aa  96.3  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.92 
 
 
868 aa  91.7  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  26.74 
 
 
1250 aa  89.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  30.75 
 
 
1626 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.44 
 
 
1357 aa  86.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27.15 
 
 
1741 aa  84.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.09 
 
 
820 aa  82  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.04 
 
 
1234 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.89 
 
 
1277 aa  78.2  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.62 
 
 
806 aa  74.7  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 
825 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  29.61 
 
 
1004 aa  73.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  42.11 
 
 
506 aa  73.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  29.61 
 
 
997 aa  73.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  42.11 
 
 
506 aa  73.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.31 
 
 
1023 aa  71.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.52 
 
 
924 aa  70.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.18 
 
 
819 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  26.65 
 
 
864 aa  70.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.83 
 
 
1086 aa  70.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  25.17 
 
 
909 aa  69.7  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  41.03 
 
 
2057 aa  67.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  39.17 
 
 
3322 aa  66.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  32.58 
 
 
1234 aa  65.5  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  39.64 
 
 
955 aa  64.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  39.64 
 
 
955 aa  64.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.58 
 
 
1234 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  32.21 
 
 
1252 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  32.58 
 
 
1234 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  31.46 
 
 
1250 aa  63.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  34.3 
 
 
1254 aa  63.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  26.02 
 
 
1971 aa  62  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  26.59 
 
 
1049 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  25.19 
 
 
759 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  25.19 
 
 
759 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.1 
 
 
1055 aa  61.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.99 
 
 
1197 aa  60.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  25.19 
 
 
759 aa  59.7  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  35.38 
 
 
818 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  35.82 
 
 
927 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 
995 aa  55.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  27.02 
 
 
948 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  26.86 
 
 
948 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.13 
 
 
769 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  27.07 
 
 
949 aa  52  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  37.4 
 
 
914 aa  52  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.92 
 
 
1122 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  26.58 
 
 
948 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  22.77 
 
 
709 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>