131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1341 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 
1040 aa  2038    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  32.72 
 
 
947 aa  337  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  38.79 
 
 
1093 aa  323  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  38.79 
 
 
1093 aa  323  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  37.8 
 
 
1099 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  36.77 
 
 
1115 aa  308  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  36.2 
 
 
825 aa  297  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  36.2 
 
 
819 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  33.1 
 
 
1762 aa  294  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  33.1 
 
 
1762 aa  294  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  32.82 
 
 
1763 aa  290  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  35 
 
 
818 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  33.6 
 
 
1753 aa  281  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  32.12 
 
 
1748 aa  280  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  33.16 
 
 
1770 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  33.82 
 
 
1770 aa  277  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 
924 aa  263  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  41.12 
 
 
909 aa  253  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.86 
 
 
1009 aa  228  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  27.62 
 
 
1067 aa  218  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.87 
 
 
1741 aa  211  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.96 
 
 
1357 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  28.37 
 
 
1070 aa  208  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.43 
 
 
1070 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  35.92 
 
 
914 aa  205  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  35.13 
 
 
1049 aa  202  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.9 
 
 
1055 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  33.43 
 
 
927 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.65 
 
 
3420 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.26 
 
 
1028 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.65 
 
 
3415 aa  181  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.62 
 
 
1023 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  28.31 
 
 
1594 aa  165  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  26.95 
 
 
995 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  31.13 
 
 
1277 aa  149  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  28.57 
 
 
1806 aa  147  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  29.68 
 
 
1012 aa  146  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.54 
 
 
868 aa  141  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.6 
 
 
1327 aa  140  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 
950 aa  138  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  27.57 
 
 
1579 aa  137  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  27.97 
 
 
773 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  32.72 
 
 
1571 aa  131  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  29.02 
 
 
466 aa  131  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.87 
 
 
1165 aa  128  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.87 
 
 
1165 aa  128  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.23 
 
 
2926 aa  128  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  29.93 
 
 
1113 aa  127  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.89 
 
 
4312 aa  126  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.96 
 
 
1086 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  25.63 
 
 
820 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  29.5 
 
 
1593 aa  122  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.69 
 
 
4391 aa  122  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  24.92 
 
 
955 aa  121  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  26.55 
 
 
2637 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  26.35 
 
 
1349 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  25.04 
 
 
989 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  26.35 
 
 
1327 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  26.15 
 
 
1327 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.74 
 
 
1268 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 
1269 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  24.97 
 
 
955 aa  112  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 
1068 aa  111  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  27.73 
 
 
1259 aa  111  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27.74 
 
 
1254 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.31 
 
 
1259 aa  108  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  30.77 
 
 
358 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.31 
 
 
1285 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  27.06 
 
 
358 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  28.1 
 
 
1108 aa  107  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  30.1 
 
 
948 aa  106  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  28.32 
 
 
949 aa  107  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  27.92 
 
 
2057 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  27.39 
 
 
389 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  29.74 
 
 
358 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  25 
 
 
1008 aa  104  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  28.63 
 
 
948 aa  101  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  28.95 
 
 
948 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  30.3 
 
 
356 aa  100  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  26.69 
 
 
1102 aa  99.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  27.08 
 
 
2906 aa  96.3  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.93 
 
 
1039 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  36.04 
 
 
861 aa  94.7  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0073  outer membrane autotransporter  26.22 
 
 
943 aa  94  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.475524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  26.34 
 
 
709 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  32.47 
 
 
1626 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.9 
 
 
806 aa  88.2  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.99 
 
 
769 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  24.05 
 
 
1602 aa  85.1  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  30.45 
 
 
1234 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  25.3 
 
 
729 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  24.84 
 
 
730 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  25 
 
 
733 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.38 
 
 
773 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1896  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.68 
 
 
780 aa  72.8  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.69 
 
 
1197 aa  73.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  23.88 
 
 
638 aa  72  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  23.88 
 
 
638 aa  72  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  23.67 
 
 
638 aa  71.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  26.86 
 
 
1004 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>