137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0743 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  86.16 
 
 		 4391 aa  6707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 4312 aa  8136    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  40.48 
 
 		 1806 aa  688    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  41.51 
 
 		 2637 aa  730    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  49.19 
 
 		 1349 aa  501  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  49.19 
 
 		 1327 aa  499  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  48.99 
 
 		 1327 aa  498  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  49.69 
 
 		 1594 aa  493  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  38.27 
 
 		 1626 aa  474  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  46.48 
 
 		 1579 aa  462  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  42.69 
 
 		 1327 aa  450  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  47.38 
 
 		 466 aa  434  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.96 
 
 		 868 aa  412  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  58.64 
 
 		 955 aa  414  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1165 aa  410  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1165 aa  410  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  45.93 
 
 		 773 aa  411  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  57.41 
 
 		 955 aa  408  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  35.04 
 
 		 1102 aa  337  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  50.5 
 
 		 338 aa  315  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  47.88 
 
 		 306 aa  308  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  43.81 
 
 		 1004 aa  305  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  31.68 
 
 		 989 aa  303  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  42.9 
 
 		 997 aa  298  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  34.88 
 
 		 1234 aa  257  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2123  putative lipoprotein  37 
 
 		 1297 aa  250  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.590284  normal  0.395646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  32.92 
 
 		 1277 aa  243  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.71 
 
 		 806 aa  243  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  32.3 
 
 		 2057 aa  229  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  30.59 
 
 		 1252 aa  200  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.72 
 
 		 1234 aa  196  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  29.72 
 
 		 1250 aa  196  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  29.72 
 
 		 1234 aa  196  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.6 
 
 		 950 aa  192  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  29.41 
 
 		 1254 aa  192  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  29.52 
 
 		 1234 aa  191  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  28.31 
 
 		 1250 aa  182  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  29.17 
 
 		 1113 aa  182  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  30.9 
 
 		 3322 aa  182  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  31.31 
 
 		 2926 aa  178  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.39 
 
 		 3420 aa  168  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  29.39 
 
 		 3415 aa  168  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  31.02 
 
 		 1108 aa  166  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.06 
 
 		 1086 aa  159  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  31.73 
 
 		 1068 aa  158  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.17 
 
 		 1028 aa  156  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  31.61 
 
 		 1012 aa  147  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 2578 aa  145  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 2906 aa  145  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  28.8 
 
 		 1571 aa  141  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  27.94 
 
 		 995 aa  142  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 1861 aa  138  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.69 
 
 		 1040 aa  126  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  29.89 
 
 		 861 aa  124  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.05 
 
 		 1023 aa  120  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.01 
 
 		 1099 aa  119  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  26.96 
 
 		 1115 aa  119  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  28.37 
 
 		 1593 aa  117  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  27.91 
 
 		 947 aa  116  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 		 825 aa  108  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 		 819 aa  107  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.11 
 
 		 1067 aa  107  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  28.98 
 
 		 1770 aa  105  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 1763 aa  105  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  25.25 
 
 		 1741 aa  104  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  28.5 
 
 		 1259 aa  105  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  28.61 
 
 		 1268 aa  104  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.86 
 
 		 1285 aa  104  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.12 
 
 		 1753 aa  103  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  28.18 
 
 		 1770 aa  103  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.72 
 
 		 1070 aa  103  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28 
 
 		 1259 aa  102  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  27.51 
 
 		 1070 aa  102  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  27.27 
 
 		 1762 aa  101  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 1762 aa  101  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  28 
 
 		 1269 aa  100  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27.75 
 
 		 1254 aa  98.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  26.42 
 
 		 1093 aa  97.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 		 1093 aa  97.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  27.6 
 
 		 773 aa  94  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.74 
 
 		 1748 aa  94.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 		 733 aa  90.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  22.92 
 
 		 1602 aa  80.5  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.41 
 
 		 1357 aa  75.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  28.62 
 
 		 732 aa  74.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  26.78 
 
 		 1008 aa  73.6  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 		 914 aa  73.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  22.76 
 
 		 924 aa  73.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.36 
 
 		 729 aa  73.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  30.43 
 
 		 769 aa  72.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  39.82 
 
 		 864 aa  72.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  43.7 
 
 		 909 aa  72.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.04 
 
 		 870 aa  69.7  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  39.81 
 
 		 1049 aa  69.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.31 
 
 		 731 aa  68.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  32.89 
 
 		 818 aa  68.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  28.29 
 
 		 709 aa  68.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.59 
 
 		 1009 aa  67.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  25.17 
 
 		 815 aa  66.6  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.84 
 
 		 1055 aa  66.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>