151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6171 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  95.07 
 
 		 1459 aa  2182    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1458 aa  2665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  80.1 
 
 		 1322 aa  1168    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  38.68 
 
 		 1172 aa  349  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.97 
 
 		 1694 aa  269  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  37.88 
 
 		 2396 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.85 
 
 		 1532 aa  247  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.9 
 
 		 3629 aa  218  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  37.18 
 
 		 2346 aa  214  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  37.49 
 
 		 2365 aa  214  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  41.23 
 
 		 2366 aa  206  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  43.04 
 
 		 2407 aa  204  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  34.64 
 
 		 2906 aa  196  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.87 
 
 		 1508 aa  191  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  42.04 
 
 		 1111 aa  191  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  36.8 
 
 		 1971 aa  191  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.61 
 
 		 1227 aa  188  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.08 
 
 		 1848 aa  185  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  35.28 
 
 		 1550 aa  182  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  41.03 
 
 		 2371 aa  175  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  35.83 
 
 		 1881 aa  172  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  30.84 
 
 		 2711 aa  172  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  36.15 
 
 		 1130 aa  171  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  35.38 
 
 		 1530 aa  166  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  34.84 
 
 		 3954 aa  162  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  32.96 
 
 		 2578 aa  155  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  30.49 
 
 		 1782 aa  150  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  37.24 
 
 		 1741 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  29.59 
 
 		 1119 aa  149  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  33.97 
 
 		 3322 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  41.33 
 
 		 4238 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  41.08 
 
 		 3822 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  41.08 
 
 		 4238 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.27 
 
 		 1285 aa  136  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.38 
 
 		 1029 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.1 
 
 		 1081 aa  125  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  28.86 
 
 		 2003 aa  119  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  35.38 
 
 		 2926 aa  118  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  32.66 
 
 		 3506 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  36.41 
 
 		 1180 aa  115  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  44.27 
 
 		 1861 aa  110  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  34.5 
 
 		 1882 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  41.04 
 
 		 861 aa  110  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  30.19 
 
 		 1066 aa  107  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  28.34 
 
 		 995 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  28.31 
 
 		 1001 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.98 
 
 		 919 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  40.87 
 
 		 1113 aa  105  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  33.79 
 
 		 3420 aa  105  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  33.6 
 
 		 3415 aa  103  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  27.42 
 
 		 1519 aa  102  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  28.29 
 
 		 1333 aa  99.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  43.8 
 
 		 1571 aa  97.1  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.63 
 
 		 2057 aa  96.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.13 
 
 		 1489 aa  96.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.92 
 
 		 1001 aa  96.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  27.4 
 
 		 986 aa  96.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  26.8 
 
 		 990 aa  94.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.14 
 
 		 1004 aa  92  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  34.69 
 
 		 950 aa  91.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.5 
 
 		 2363 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  43.37 
 
 		 1164 aa  89.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  28.15 
 
 		 991 aa  89  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  28.89 
 
 		 1055 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  28.92 
 
 		 983 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  26.6 
 
 		 1028 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.71 
 
 		 1011 aa  87  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.57 
 
 		 1033 aa  84.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  38.99 
 
 		 1177 aa  83.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  27.63 
 
 		 995 aa  83.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  32.23 
 
 		 852 aa  82.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  27.23 
 
 		 1038 aa  82  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.66 
 
 		 1125 aa  81.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  35.52 
 
 		 987 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  27.88 
 
 		 882 aa  79.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.46 
 
 		 907 aa  79.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  36.01 
 
 		 816 aa  78.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  29.13 
 
 		 1593 aa  76.3  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  25.42 
 
 		 2848 aa  74.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.32 
 
 		 972 aa  72.4  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  33.05 
 
 		 965 aa  72.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  27.42 
 
 		 1012 aa  71.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  29.24 
 
 		 994 aa  71.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  27.49 
 
 		 1019 aa  70.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  40.54 
 
 		 677 aa  70.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  28.75 
 
 		 1626 aa  70.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  38 
 
 		 1093 aa  69.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  38 
 
 		 1093 aa  69.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  37.14 
 
 		 1099 aa  68.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  29.97 
 
 		 1806 aa  68.6  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.46 
 
 		 1769 aa  68.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  25.42 
 
 		 998 aa  67.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  39.39 
 
 		 970 aa  67.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  33.04 
 
 		 2642 aa  66.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  34.72 
 
 		 909 aa  64.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  29.41 
 
 		 4391 aa  64.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  33.18 
 
 		 650 aa  64.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2123  putative lipoprotein  31.29 
 
 		 1297 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.590284  normal  0.395646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1446 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.56 
 
 		 1055 aa  63.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>