93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3958 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  100 
 
 
907 aa  1771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  57.86 
 
 
882 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  54.79 
 
 
1081 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  50.4 
 
 
2407 aa  535  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  53.51 
 
 
1078 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  45.22 
 
 
1019 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  53.15 
 
 
1111 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  52.04 
 
 
1130 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  52.03 
 
 
987 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  51.63 
 
 
814 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  52.35 
 
 
1180 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.48 
 
 
1532 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  34.86 
 
 
1177 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  42.51 
 
 
678 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  24.88 
 
 
4248 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  46.62 
 
 
190 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0245  Outer membrane autotransporter barrel  32.75 
 
 
2175 aa  115  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203155  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.92 
 
 
1029 aa  90.5  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  28.98 
 
 
2366 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  28.98 
 
 
2371 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  28.05 
 
 
2365 aa  89.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  28.05 
 
 
2346 aa  89  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  27.66 
 
 
1119 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1670  outer membrane autotransporter  28.99 
 
 
3046 aa  85.1  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.999552 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.7 
 
 
1489 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  29.07 
 
 
2396 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 
1458 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.38 
 
 
1769 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 
1152 aa  77.4  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  25.75 
 
 
1459 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  27.68 
 
 
1508 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  25.9 
 
 
980 aa  74.7  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  28.84 
 
 
1782 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  26.21 
 
 
1028 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  26.54 
 
 
1016 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  25.55 
 
 
1038 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.47 
 
 
994 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.35 
 
 
1322 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.86 
 
 
991 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  26.47 
 
 
3506 aa  67  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.91 
 
 
985 aa  67  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  30.17 
 
 
1012 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.86 
 
 
1179 aa  65.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 
1056 aa  64.7  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25 
 
 
1369 aa  64.3  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.63 
 
 
1227 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.18 
 
 
919 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  25.05 
 
 
1550 aa  62.4  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.47 
 
 
995 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.27 
 
 
915 aa  61.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.51 
 
 
1011 aa  61.2  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.22 
 
 
1848 aa  60.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0250  outer membrane autotransporter  29.68 
 
 
4368 aa  59.7  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2539  Outer membrane autotransporter barrel  28.79 
 
 
1778 aa  60.1  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0263  hypothetical protein  38.33 
 
 
3497 aa  59.7  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  43.16 
 
 
1001 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 
1004 aa  59.7  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.53 
 
 
1125 aa  59.3  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  23.1 
 
 
816 aa  58.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.17 
 
 
1285 aa  55.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  40.21 
 
 
1001 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  21.71 
 
 
1519 aa  55.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.29 
 
 
926 aa  54.7  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  24.48 
 
 
1154 aa  54.7  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  27.83 
 
 
939 aa  54.7  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  28.23 
 
 
959 aa  54.7  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.19 
 
 
1156 aa  54.7  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  25.74 
 
 
650 aa  53.9  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 
1033 aa  53.5  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  37.63 
 
 
983 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  26.44 
 
 
1886 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  23.76 
 
 
986 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.48 
 
 
913 aa  53.5  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  26.5 
 
 
831 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.01 
 
 
1055 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.69 
 
 
972 aa  52  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.08 
 
 
774 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  26.03 
 
 
1333 aa  50.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  24.68 
 
 
2083 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  23.86 
 
 
995 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.5 
 
 
1134 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  27.42 
 
 
911 aa  48.1  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  26.54 
 
 
763 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.64 
 
 
972 aa  47.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.69 
 
 
1277 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2839  outer membrane autotransporter  40.85 
 
 
1105 aa  47.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162754  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  26.07 
 
 
759 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.73 
 
 
910 aa  46.2  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  25.19 
 
 
765 aa  45.8  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  28.4 
 
 
723 aa  45.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.49 
 
 
960 aa  44.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  28.83 
 
 
3954 aa  44.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  21.68 
 
 
1011 aa  44.3  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>