68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4997 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 998 aa  1951    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  34.42 
 
 		 10429 aa  323  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.02 
 
 		 1242 aa  308  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  27.96 
 
 		 831 aa  200  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  27.22 
 
 		 1068 aa  144  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.05 
 
 		 972 aa  117  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.27 
 
 		 1012 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  25.27 
 
 		 1677 aa  114  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  28.21 
 
 		 939 aa  105  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.78 
 
 		 774 aa  99.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.66 
 
 		 763 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  27.71 
 
 		 759 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  25.53 
 
 		 1001 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 		 2848 aa  75.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  25.95 
 
 		 1025 aa  76.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  28.02 
 
 		 1001 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 		 1459 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  25.42 
 
 		 1458 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.89 
 
 		 1028 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  23.96 
 
 		 1886 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1329  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 		 1058 aa  63.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0892684  normal  0.563685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  28.25 
 
 		 983 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.81 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.52 
 
 		 1769 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  25.95 
 
 		 1011 aa  59.7  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.82 
 
 		 1489 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.08 
 
 		 1322 aa  58.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3913  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 		 1091 aa  57.4  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3845  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.86 
 
 		 826 aa  57.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.67 
 
 		 1369 aa  57  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  25.86 
 
 		 1131 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  25.86 
 
 		 1129 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  25.86 
 
 		 1129 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  27.62 
 
 		 4238 aa  56.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  27.62 
 
 		 4238 aa  56.2  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  25.86 
 
 		 1131 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  25.86 
 
 		 1131 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  25.86 
 
 		 1131 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  27.08 
 
 		 995 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  27.62 
 
 		 3822 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.42 
 
 		 919 aa  55.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  26.14 
 
 		 3954 aa  55.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  25.05 
 
 		 1056 aa  54.7  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  22.41 
 
 		 3506 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  24.75 
 
 		 991 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  27 
 
 		 728 aa  53.5  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  27 
 
 		 728 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  27 
 
 		 728 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  23.08 
 
 		 1038 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.82 
 
 		 1256 aa  52.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  23.05 
 
 		 1055 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  25.71 
 
 		 1131 aa  52.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0245  Outer membrane autotransporter barrel  24.83 
 
 		 2175 aa  51.6  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 1865 aa  50.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  25.52 
 
 		 2003 aa  50.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 1842 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.42 
 
 		 2302 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.47 
 
 		 1004 aa  50.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 3015 aa  49.3  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.47 
 
 		 1033 aa  49.7  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.42 
 
 		 1953 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  24.05 
 
 		 990 aa  48.9  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  23.94 
 
 		 650 aa  48.9  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  24.31 
 
 		 1130 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.22 
 
 		 972 aa  47.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.68 
 
 		 1782 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.05 
 
 		 1227 aa  45.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1941  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.12 
 
 		 2263 aa  44.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>