53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3276 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  100 
 
 
728 aa  1473    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  99.86 
 
 
728 aa  1471    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  99.86 
 
 
728 aa  1471    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  25.22 
 
 
759 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.66 
 
 
763 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.88 
 
 
1369 aa  75.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  24.83 
 
 
972 aa  71.2  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.63 
 
 
1156 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  28.22 
 
 
1154 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 
939 aa  62  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  27.07 
 
 
607 aa  60.1  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.6 
 
 
1134 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  28.32 
 
 
816 aa  58.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.8 
 
 
1004 aa  57.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  24.14 
 
 
646 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.8 
 
 
1033 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.03 
 
 
1179 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.36 
 
 
913 aa  55.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  24.14 
 
 
646 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.35 
 
 
915 aa  55.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.74 
 
 
1242 aa  54.7  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  24.37 
 
 
1886 aa  53.9  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.19 
 
 
1012 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  27 
 
 
998 aa  53.9  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  23.3 
 
 
664 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  24.84 
 
 
658 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  24.57 
 
 
637 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  23.13 
 
 
629 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  26.46 
 
 
1001 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.48 
 
 
919 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.48 
 
 
995 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.82 
 
 
641 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.56 
 
 
1048 aa  50.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  25.97 
 
 
2711 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  25.5 
 
 
1677 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  21.84 
 
 
684 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.14 
 
 
729 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  22.61 
 
 
629 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  21.84 
 
 
629 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  22.76 
 
 
626 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 
10429 aa  48.9  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  21.64 
 
 
980 aa  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.44 
 
 
983 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.44 
 
 
1001 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  25.09 
 
 
2848 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  25.22 
 
 
990 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  21.74 
 
 
723 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  25.11 
 
 
991 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  23.5 
 
 
636 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  26.25 
 
 
636 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  22.82 
 
 
684 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.91 
 
 
629 aa  45.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  20.97 
 
 
1782 aa  44.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>