116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2238 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  100 
 
 		 1025 aa  2023    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  28.85 
 
 		 939 aa  136  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.57 
 
 		 1012 aa  129  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.83 
 
 		 774 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  28.28 
 
 		 972 aa  107  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.35 
 
 		 919 aa  91.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.21 
 
 		 1033 aa  91.3  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.21 
 
 		 1004 aa  90.9  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  28.74 
 
 		 1066 aa  89.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  33.96 
 
 		 1508 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  28.72 
 
 		 1782 aa  85.1  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.59 
 
 		 1001 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.34 
 
 		 1769 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.46 
 
 		 1001 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  29.72 
 
 		 2396 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  24.33 
 
 		 1056 aa  78.2  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  30.12 
 
 		 2371 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  26.3 
 
 		 1011 aa  76.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  29.72 
 
 		 2365 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  25.95 
 
 		 998 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.24 
 
 		 995 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  29.72 
 
 		 2346 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  28.34 
 
 		 1119 aa  75.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  26.48 
 
 		 1016 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  25.27 
 
 		 985 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  30.12 
 
 		 2366 aa  75.5  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 		 1369 aa  74.7  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.27 
 
 		 1055 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.62 
 
 		 991 aa  74.7  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  28.83 
 
 		 986 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26.27 
 
 		 1038 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  27.52 
 
 		 2848 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.21 
 
 		 1227 aa  73.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  27.72 
 
 		 1130 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.2 
 
 		 1029 aa  71.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  25.09 
 
 		 994 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  28.67 
 
 		 1129 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  28.67 
 
 		 1129 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  23.74 
 
 		 983 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  28.67 
 
 		 1131 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  28.67 
 
 		 1131 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  28.67 
 
 		 1131 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  28.67 
 
 		 1131 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  28.67 
 
 		 1131 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  25.98 
 
 		 1028 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  28.11 
 
 		 995 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  31.23 
 
 		 4238 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  31.23 
 
 		 4238 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.55 
 
 		 1673 aa  65.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  26.28 
 
 		 1672 aa  65.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  31.64 
 
 		 3822 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  27.67 
 
 		 1062 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.48 
 
 		 816 aa  64.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  29.66 
 
 		 980 aa  64.3  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.28 
 
 		 1251 aa  63.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  24.34 
 
 		 2003 aa  63.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  26.98 
 
 		 1333 aa  62.4  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.76 
 
 		 1848 aa  61.2  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  24.01 
 
 		 1006 aa  60.1  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  27.67 
 
 		 1459 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 		 1886 aa  60.1  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  29.08 
 
 		 3954 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.74 
 
 		 1489 aa  59.7  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.26 
 
 		 1285 aa  58.9  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  27.16 
 
 		 2711 aa  58.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.4 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  27.56 
 
 		 629 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1881 aa  57.4  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.68 
 
 		 972 aa  57.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  24.8 
 
 		 626 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  27.34 
 
 		 1458 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  26.79 
 
 		 646 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.18 
 
 		 1177 aa  57  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  26.79 
 
 		 646 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1053 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  26.38 
 
 		 1519 aa  55.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  27.03 
 
 		 1164 aa  55.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  27.11 
 
 		 629 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  22.15 
 
 		 990 aa  55.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.89 
 
 		 1242 aa  55.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  26.64 
 
 		 607 aa  55.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.22 
 
 		 915 aa  55.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  22.99 
 
 		 664 aa  55.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  28.06 
 
 		 636 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  26.17 
 
 		 965 aa  55.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.32 
 
 		 913 aa  54.7  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  28.34 
 
 		 640 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  23.85 
 
 		 1068 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  26.29 
 
 		 684 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  23.94 
 
 		 763 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  22.82 
 
 		 488 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2635  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.69 
 
 		 1068 aa  53.5  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  29.27 
 
 		 1550 aa  53.5  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  25.19 
 
 		 909 aa  53.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.32 
 
 		 1125 aa  52.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  24.73 
 
 		 759 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  25.13 
 
 		 629 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  25.63 
 
 		 942 aa  51.6  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.57 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.17 
 
 		 926 aa  51.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>