159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6767 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  46.3 
 
 
2396 aa  802    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  50.85 
 
 
1508 aa  898    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  50 
 
 
2365 aa  1217    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  99.95 
 
 
3822 aa  5139    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 
415 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  49.98 
 
 
2371 aa  1082    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  50.02 
 
 
2346 aa  1217    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  100 
 
 
4238 aa  7249    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  49.86 
 
 
2366 aa  1165    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  98.58 
 
 
4238 aa  7146    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.97 
 
 
3629 aa  1025    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  73.18 
 
 
3954 aa  3345    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  40.87 
 
 
3506 aa  517  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.11 
 
 
1881 aa  451  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  36.84 
 
 
1971 aa  386  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.86 
 
 
1227 aa  355  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  32.09 
 
 
1119 aa  343  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.91 
 
 
2906 aa  324  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  39.52 
 
 
2711 aa  316  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.19 
 
 
1285 aa  316  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.95 
 
 
991 aa  313  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.73 
 
 
1848 aa  311  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 
2003 aa  306  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  37.44 
 
 
995 aa  305  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  32.07 
 
 
1550 aa  296  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.68 
 
 
1029 aa  282  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  35.45 
 
 
990 aa  280  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  35.59 
 
 
1033 aa  276  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  34.72 
 
 
1004 aa  271  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.68 
 
 
3322 aa  266  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  33.33 
 
 
986 aa  263  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  33.98 
 
 
995 aa  261  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.5 
 
 
1055 aa  259  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  34.22 
 
 
1038 aa  254  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  34.43 
 
 
1001 aa  254  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  34.46 
 
 
1028 aa  253  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  29.65 
 
 
1519 aa  249  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  34.36 
 
 
1001 aa  246  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  32.82 
 
 
650 aa  244  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 
1782 aa  244  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  33.85 
 
 
983 aa  241  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.56 
 
 
919 aa  229  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  36.6 
 
 
1053 aa  224  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  32.85 
 
 
1530 aa  222  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  44 
 
 
1459 aa  221  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.49 
 
 
972 aa  215  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  32.32 
 
 
1164 aa  213  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  44.31 
 
 
1458 aa  213  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  35.12 
 
 
1129 aa  211  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  35.12 
 
 
1131 aa  211  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  34.92 
 
 
1131 aa  209  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  34.92 
 
 
1131 aa  209  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  34.92 
 
 
1131 aa  209  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  34.92 
 
 
1129 aa  209  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.96 
 
 
1011 aa  207  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  33.77 
 
 
1130 aa  204  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  31.49 
 
 
985 aa  200  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  35.12 
 
 
1131 aa  201  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  31.86 
 
 
994 aa  198  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 
1056 aa  197  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  32.05 
 
 
1333 aa  194  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  30.53 
 
 
1011 aa  192  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  36.35 
 
 
1172 aa  181  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.47 
 
 
677 aa  171  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.84 
 
 
2578 aa  171  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  33.91 
 
 
1062 aa  170  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  33.24 
 
 
980 aa  166  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  30.94 
 
 
1152 aa  165  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  32.27 
 
 
1006 aa  164  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  31.55 
 
 
1016 aa  162  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  35.6 
 
 
2407 aa  158  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.22 
 
 
1125 aa  157  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  29.73 
 
 
1882 aa  149  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.17 
 
 
3391 aa  137  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.61 
 
 
1532 aa  136  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  36.76 
 
 
1113 aa  128  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.26 
 
 
1741 aa  125  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  34.03 
 
 
1111 aa  125  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  27.73 
 
 
2057 aa  125  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  35.35 
 
 
1130 aa  124  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.2 
 
 
1694 aa  119  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  31.01 
 
 
1593 aa  117  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.61 
 
 
1322 aa  113  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  27.49 
 
 
2848 aa  112  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  30.4 
 
 
2642 aa  109  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  33.76 
 
 
994 aa  104  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.97 
 
 
1081 aa  102  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  27.46 
 
 
488 aa  102  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  29.22 
 
 
1861 aa  99.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  31.66 
 
 
852 aa  92.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  37.27 
 
 
2926 aa  92.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  36.36 
 
 
950 aa  90.1  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28.6 
 
 
814 aa  87.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.18 
 
 
2363 aa  88.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  29.29 
 
 
407 aa  86.7  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  33.28 
 
 
1300 aa  85.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  36.24 
 
 
861 aa  84.7  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  35.03 
 
 
3420 aa  83.6  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.57 
 
 
1012 aa  82.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.63 
 
 
774 aa  83.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>