160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6355 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 4238 aa  7250    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  38.57 
 
 		 3506 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  46.17 
 
 		 2396 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  51.17 
 
 		 1508 aa  904    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  98.46 
 
 		 3822 aa  5054    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  99.23 
 
 		 415 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  49.72 
 
 		 2371 aa  1085    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  50.26 
 
 		 2346 aa  1222    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  98.58 
 
 		 4238 aa  7146    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  49.79 
 
 		 2366 aa  1173    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  50.24 
 
 		 2365 aa  1221    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.62 
 
 		 3629 aa  1027    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  73.05 
 
 		 3954 aa  3338    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1881 aa  454  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  36.78 
 
 		 1971 aa  384  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.8 
 
 		 1227 aa  355  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  32.4 
 
 		 1119 aa  342  8e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.97 
 
 		 2906 aa  324  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  40.46 
 
 		 2711 aa  314  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.07 
 
 		 1285 aa  313  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.78 
 
 		 991 aa  312  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35 
 
 		 1848 aa  311  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.37 
 
 		 2003 aa  308  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  37.09 
 
 		 995 aa  302  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  32.11 
 
 		 1550 aa  300  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.83 
 
 		 1029 aa  284  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  35.45 
 
 		 990 aa  280  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  35.42 
 
 		 1033 aa  275  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  34.56 
 
 		 1004 aa  271  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  33.48 
 
 		 986 aa  265  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  33.83 
 
 		 995 aa  260  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.37 
 
 		 1055 aa  258  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  34.43 
 
 		 1001 aa  256  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  34.06 
 
 		 1038 aa  253  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  34.29 
 
 		 1028 aa  252  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  29.65 
 
 		 1519 aa  249  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  34.36 
 
 		 1001 aa  247  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  31.77 
 
 		 1782 aa  245  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  32.82 
 
 		 650 aa  245  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  33.68 
 
 		 983 aa  240  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.63 
 
 		 919 aa  230  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  31.69 
 
 		 1530 aa  225  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  36.45 
 
 		 1053 aa  224  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.1 
 
 		 3322 aa  223  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  44 
 
 		 1459 aa  221  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.06 
 
 		 972 aa  215  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  44.31 
 
 		 1458 aa  213  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 		 1164 aa  213  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  34.92 
 
 		 1129 aa  211  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  34.92 
 
 		 1131 aa  211  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  34.72 
 
 		 1129 aa  209  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  34.72 
 
 		 1131 aa  209  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  34.72 
 
 		 1131 aa  209  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  34.72 
 
 		 1131 aa  209  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.82 
 
 		 1011 aa  206  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  33.62 
 
 		 1130 aa  204  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  31.49 
 
 		 985 aa  201  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  34.92 
 
 		 1131 aa  200  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 1056 aa  198  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  31.7 
 
 		 994 aa  197  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  32.05 
 
 		 1333 aa  194  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  30.53 
 
 		 1011 aa  193  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  36.83 
 
 		 1172 aa  182  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.32 
 
 		 677 aa  171  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.56 
 
 		 2578 aa  171  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  33.72 
 
 		 1062 aa  170  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  33.24 
 
 		 980 aa  166  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  30.75 
 
 		 1152 aa  164  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.99 
 
 		 1006 aa  164  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  31.55 
 
 		 1016 aa  163  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1882 aa  160  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.01 
 
 		 1125 aa  156  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  34.85 
 
 		 2407 aa  153  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.89 
 
 		 3391 aa  137  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.36 
 
 		 1532 aa  134  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  36.97 
 
 		 1113 aa  131  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.3 
 
 		 1322 aa  131  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.98 
 
 		 1741 aa  126  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  34.03 
 
 		 1111 aa  125  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.52 
 
 		 1694 aa  125  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  27.88 
 
 		 2057 aa  122  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  35.15 
 
 		 1130 aa  122  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  27.49 
 
 		 2848 aa  113  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29 
 
 		 1081 aa  104  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  29.67 
 
 		 1593 aa  103  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  34.91 
 
 		 994 aa  102  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  27.46 
 
 		 488 aa  102  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  29.98 
 
 		 2642 aa  101  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.16 
 
 		 3415 aa  99.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  32.26 
 
 		 852 aa  91.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.74 
 
 		 3089 aa  90.1  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  36.36 
 
 		 950 aa  90.1  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28.87 
 
 		 814 aa  89.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.5 
 
 		 2363 aa  89.4  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  36.42 
 
 		 2926 aa  88.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  29.29 
 
 		 407 aa  87.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  36.24 
 
 		 861 aa  85.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.63 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.57 
 
 		 1012 aa  83.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1300 aa  78.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>