158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0892 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  100 
 
 		 1016 aa  2016    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  35.73 
 
 		 1056 aa  479  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  33.84 
 
 		 1011 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.7 
 
 		 1227 aa  226  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  28.37 
 
 		 1519 aa  226  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.79 
 
 		 3506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  35.48 
 
 		 1550 aa  218  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  29.35 
 
 		 1001 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.92 
 
 		 919 aa  210  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  29.19 
 
 		 1001 aa  208  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.77 
 
 		 1029 aa  207  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  29.98 
 
 		 991 aa  207  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  33.9 
 
 		 1508 aa  205  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  29.38 
 
 		 1028 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  29.97 
 
 		 995 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  37.3 
 
 		 994 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  33.6 
 
 		 2003 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  34.78 
 
 		 995 aa  200  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  34.46 
 
 		 986 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 		 2365 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 		 2346 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  35.71 
 
 		 1164 aa  197  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  35.52 
 
 		 985 aa  197  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.76 
 
 		 972 aa  196  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  26.98 
 
 		 983 aa  196  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  30.91 
 
 		 2371 aa  194  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  33.43 
 
 		 1782 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  30.91 
 
 		 2366 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  34.22 
 
 		 1038 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  31.75 
 
 		 1119 aa  191  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  35.01 
 
 		 1004 aa  190  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  33.51 
 
 		 2396 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  35.28 
 
 		 1033 aa  187  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  33.69 
 
 		 1055 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.81 
 
 		 1848 aa  177  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  31.07 
 
 		 650 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.38 
 
 		 1285 aa  172  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 		 4238 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  31.46 
 
 		 4238 aa  171  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  31.82 
 
 		 3822 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  32.64 
 
 		 677 aa  169  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  31.63 
 
 		 3954 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.93 
 
 		 1125 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  32.8 
 
 		 1333 aa  159  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.03 
 
 		 1011 aa  153  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  31.33 
 
 		 407 aa  151  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  30.29 
 
 		 1006 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  30.5 
 
 		 1130 aa  149  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  29.63 
 
 		 1129 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  29.63 
 
 		 1129 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  29.63 
 
 		 1131 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  29.63 
 
 		 1131 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  29.63 
 
 		 1131 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  29.63 
 
 		 1131 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  30 
 
 		 980 aa  147  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30.47 
 
 		 488 aa  145  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  33.21 
 
 		 1131 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  28.25 
 
 		 990 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  28.5 
 
 		 1152 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  28.89 
 
 		 1062 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  31.28 
 
 		 1053 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1881 aa  114  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.64 
 
 		 3629 aa  105  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.38 
 
 		 1081 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  29.44 
 
 		 2711 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  59.32 
 
 		 268 aa  87.8  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  27.95 
 
 		 2407 aa  85.5  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.62 
 
 		 774 aa  83.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  26.1 
 
 		 814 aa  80.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.26 
 
 		 926 aa  79.7  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  26.48 
 
 		 1025 aa  76.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  24.05 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  26.11 
 
 		 939 aa  72  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  27.37 
 
 		 882 aa  68.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.37 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  54.1 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  25.83 
 
 		 1130 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  36.16 
 
 		 987 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  38.98 
 
 		 1180 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  24.34 
 
 		 1019 aa  65.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.49 
 
 		 1322 aa  64.7  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  23.95 
 
 		 1066 aa  63.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  29.69 
 
 		 1012 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.7 
 
 		 1489 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  42.71 
 
 		 1281 aa  63.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.1 
 
 		 913 aa  62.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  32.8 
 
 		 816 aa  62.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.42 
 
 		 915 aa  62  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  27.47 
 
 		 1179 aa  62  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  24.91 
 
 		 1078 aa  62  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  27.83 
 
 		 1459 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  27.83 
 
 		 1458 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  48.68 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  27.65 
 
 		 1154 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.52 
 
 		 1156 aa  58.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  21.22 
 
 		 1769 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.85 
 
 		 1134 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.09 
 
 		 1532 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  23.14 
 
 		 2083 aa  57.4  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  25.48 
 
 		 628 aa  57.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>