110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5638 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 488 aa  1001    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  44.42 
 
 		 985 aa  359  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  45.92 
 
 		 994 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  35.06 
 
 		 3506 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  34.26 
 
 		 986 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  32.86 
 
 		 995 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  33.73 
 
 		 1011 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  34.69 
 
 		 1056 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.42 
 
 		 1029 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  31.59 
 
 		 1038 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  30.21 
 
 		 991 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  31.32 
 
 		 1004 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  31.32 
 
 		 1033 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  31.55 
 
 		 1016 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  30.64 
 
 		 1508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.09 
 
 		 1125 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.1 
 
 		 1055 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  30.53 
 
 		 995 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  34.43 
 
 		 2003 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  30.09 
 
 		 983 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.82 
 
 		 919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  28.68 
 
 		 1119 aa  128  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  28.7 
 
 		 650 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  30.91 
 
 		 1131 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  30.91 
 
 		 1131 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  30.91 
 
 		 1131 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  30.91 
 
 		 1129 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  30.91 
 
 		 1129 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  31.44 
 
 		 1028 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  30.91 
 
 		 1131 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  32.72 
 
 		 2396 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  33.09 
 
 		 2371 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.45 
 
 		 1001 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  29.32 
 
 		 1130 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  32.72 
 
 		 2365 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  32.72 
 
 		 2346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  33.09 
 
 		 2366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  33.58 
 
 		 1131 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  30 
 
 		 980 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.2 
 
 		 1227 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.6 
 
 		 1285 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  29.32 
 
 		 1001 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  33.08 
 
 		 1053 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.99 
 
 		 1848 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.17 
 
 		 972 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  28.07 
 
 		 3954 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  30.55 
 
 		 1164 aa  110  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  26.86 
 
 		 4238 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  26.86 
 
 		 4238 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  26.86 
 
 		 3822 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  30 
 
 		 1550 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  30 
 
 		 1062 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  29.41 
 
 		 677 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  26.76 
 
 		 990 aa  94  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  27.59 
 
 		 1519 aa  93.6  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  29.6 
 
 		 407 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  27.95 
 
 		 1152 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  26.37 
 
 		 1782 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  26.04 
 
 		 1006 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  27.82 
 
 		 1333 aa  83.2  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  27.69 
 
 		 2711 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.31 
 
 		 1011 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  23.62 
 
 		 1769 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.33 
 
 		 774 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.74 
 
 		 1489 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  24.81 
 
 		 1154 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  27.03 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 1156 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  27.57 
 
 		 972 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  31.37 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  31.37 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  20.43 
 
 		 4248 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3186  putative autotransporter  35.11 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  24.24 
 
 		 1179 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  30.32 
 
 		 629 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.56 
 
 		 1134 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  27.22 
 
 		 1012 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  29.41 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  23.95 
 
 		 763 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.11 
 
 		 913 aa  53.5  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  23.95 
 
 		 759 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  22.82 
 
 		 1025 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.86 
 
 		 926 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.2 
 
 		 816 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  27.72 
 
 		 646 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.15 
 
 		 960 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 664 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  25.32 
 
 		 939 aa  50.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.11 
 
 		 915 aa  50.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  26.67 
 
 		 637 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  24.88 
 
 		 1068 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  26.94 
 
 		 640 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.14 
 
 		 594 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1881 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.28 
 
 		 814 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  24.27 
 
 		 2407 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  26.63 
 
 		 646 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1996  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.31 
 
 		 1669 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.357801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  26.42 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.29 
 
 		 1004 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>