122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1722 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 1530 aa  2828    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1881 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.69 
 
 		 3629 aa  337  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.14 
 
 		 1532 aa  321  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  36.3 
 
 		 3322 aa  275  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  32.12 
 
 		 2906 aa  268  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  34.86 
 
 		 2578 aa  253  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  31.4 
 
 		 1971 aa  238  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  33.08 
 
 		 2396 aa  226  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  31.8 
 
 		 3506 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  37.33 
 
 		 2711 aa  204  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.16 
 
 		 1119 aa  195  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  33.11 
 
 		 1782 aa  193  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  32.36 
 
 		 2366 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  31.92 
 
 		 1458 aa  175  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  32.96 
 
 		 2365 aa  171  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  32.96 
 
 		 2346 aa  171  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.25 
 
 		 1081 aa  168  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  31.12 
 
 		 2003 aa  158  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  37.56 
 
 		 2407 aa  157  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  40.31 
 
 		 1113 aa  155  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.16 
 
 		 1322 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  34.32 
 
 		 1508 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  38.75 
 
 		 2926 aa  142  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 		 1459 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.61 
 
 		 1741 aa  138  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  30.12 
 
 		 1882 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.72 
 
 		 2057 aa  127  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  37.58 
 
 		 1861 aa  115  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  30.29 
 
 		 2371 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 		 3415 aa  110  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.93 
 
 		 1227 aa  110  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  31.55 
 
 		 2642 aa  108  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.17 
 
 		 2363 aa  105  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  43.98 
 
 		 1519 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  35.29 
 
 		 1130 aa  103  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.9 
 
 		 3391 aa  102  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  30.55 
 
 		 4238 aa  102  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  30.71 
 
 		 3954 aa  101  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  29.74 
 
 		 852 aa  95.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  37.21 
 
 		 861 aa  95.5  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  40.95 
 
 		 1593 aa  94.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  46.23 
 
 		 1571 aa  92.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  27.72 
 
 		 3420 aa  92.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  34.42 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  36.36 
 
 		 995 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  28.86 
 
 		 1550 aa  84  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  36.15 
 
 		 986 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  31.99 
 
 		 1180 aa  83.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  34.36 
 
 		 3822 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.77 
 
 		 1029 aa  82  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.38 
 
 		 1953 aa  80.9  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  31.67 
 
 		 1111 aa  79.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  28.21 
 
 		 994 aa  78.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  31.06 
 
 		 4238 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.3 
 
 		 1848 aa  75.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  37.46 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  40.56 
 
 		 1115 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.52 
 
 		 1357 aa  75.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  44.98 
 
 		 1053 aa  73.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1300 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  34.72 
 
 		 991 aa  69.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  39.57 
 
 		 1108 aa  68.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  28.95 
 
 		 3089 aa  68.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  29.31 
 
 		 1172 aa  66.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  31.42 
 
 		 1632 aa  66.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 		 950 aa  65.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  37.78 
 
 		 860 aa  65.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  41.18 
 
 		 1055 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.96 
 
 		 1011 aa  63.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.42 
 
 		 1806 aa  64.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  40.31 
 
 		 1001 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  33.5 
 
 		 1078 aa  63.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  34.38 
 
 		 1099 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.78 
 
 		 3015 aa  63.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.24 
 
 		 348 aa  63.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  33.68 
 
 		 1028 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.78 
 
 		 1093 aa  62.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.78 
 
 		 1093 aa  62.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  40 
 
 		 1004 aa  62  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.57 
 
 		 661 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  33.97 
 
 		 1033 aa  60.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.95 
 
 		 1285 aa  60.1  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  39.84 
 
 		 1001 aa  59.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1718  hypothetical protein  32.84 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  0.169106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  39.82 
 
 		 983 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  37.72 
 
 		 653 aa  57.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  37.72 
 
 		 653 aa  57.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  32.12 
 
 		 995 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  45.98 
 
 		 683 aa  57  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  35.51 
 
 		 657 aa  56.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.48 
 
 		 919 aa  54.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  36.84 
 
 		 653 aa  55.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  35.46 
 
 		 1165 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  35.46 
 
 		 1165 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  41.3 
 
 		 641 aa  53.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  35.64 
 
 		 816 aa  52.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.2 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  34.21 
 
 		 652 aa  52.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  31.69 
 
 		 987 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>