76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1117 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 422 aa  803    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  51.57 
 
 		 860 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1718  hypothetical protein  44.57 
 
 		 582 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  0.169106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  40 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  35.1 
 
 		 1530 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2566  hypothetical protein  33.48 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.04 
 
 		 36805 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  37.07 
 
 		 1180 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  32.46 
 
 		 965 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  32.46 
 
 		 909 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  41.09 
 
 		 2906 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.55 
 
 		 1081 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.19 
 
 		 1694 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  34.02 
 
 		 970 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  34.02 
 
 		 949 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  34.02 
 
 		 998 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  35.93 
 
 		 970 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  52.22 
 
 		 3629 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  48.39 
 
 		 2642 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.43 
 
 		 1532 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  34.05 
 
 		 1881 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  31.49 
 
 		 882 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  29.63 
 
 		 683 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  36.05 
 
 		 1066 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  50.48 
 
 		 1508 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  30.77 
 
 		 652 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  37.58 
 
 		 1459 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  35.98 
 
 		 1971 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.46 
 
 		 3391 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  33.81 
 
 		 2396 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  31.48 
 
 		 942 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  30.26 
 
 		 652 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  43.16 
 
 		 1882 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  32.14 
 
 		 814 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.61 
 
 		 1741 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  34.32 
 
 		 1099 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  35.33 
 
 		 1782 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  31.3 
 
 		 1175 aa  50.4  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.39 
 
 		 3089 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  33.73 
 
 		 1571 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  36.57 
 
 		 2926 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  31.53 
 
 		 1451 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  36.08 
 
 		 1121 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  30 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  29.29 
 
 		 1111 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  34.16 
 
 		 1325 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  36.91 
 
 		 1458 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  29.59 
 
 		 653 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  29.59 
 
 		 653 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  37.21 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  37.21 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  33.74 
 
 		 3420 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2218  hypothetical protein  31.72 
 
 		 709 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  27.12 
 
 		 634 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  40.43 
 
 		 852 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  33.74 
 
 		 3415 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  31.4 
 
 		 994 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1845 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  39.6 
 
 		 3506 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.66 
 
 		 979 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  38.17 
 
 		 1019 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  30.77 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  31.54 
 
 		 1446 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 		 2578 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  45.71 
 
 		 2711 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  35.66 
 
 		 3322 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  32.96 
 
 		 1028 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  32.67 
 
 		 816 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  29.7 
 
 		 1369 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  34.78 
 
 		 1055 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  47.78 
 
 		 2371 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  31 
 
 		 1068 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.42 
 
 		 1156 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  37.14 
 
 		 995 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  33.57 
 
 		 986 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  36.43 
 
 		 1177 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>