More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01745 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  52.07 
 
 
949 aa  827    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  100 
 
 
942 aa  1865    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  51.04 
 
 
970 aa  814    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  51.76 
 
 
998 aa  832    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  52.57 
 
 
970 aa  833    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  50.33 
 
 
909 aa  825    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  49.48 
 
 
965 aa  832    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  49.5 
 
 
947 aa  733    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.62 
 
 
926 aa  334  5e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.85 
 
 
906 aa  302  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.23 
 
 
910 aa  293  8e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.86 
 
 
915 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.73 
 
 
913 aa  284  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  31.45 
 
 
959 aa  251  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  31.13 
 
 
911 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.78 
 
 
979 aa  218  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.02 
 
 
1028 aa  204  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  24.98 
 
 
1033 aa  191  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 
1006 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.11 
 
 
1004 aa  185  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.78 
 
 
1055 aa  180  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26.61 
 
 
1038 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.82 
 
 
1125 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.04 
 
 
954 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  28.05 
 
 
974 aa  152  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.15 
 
 
991 aa  151  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.35 
 
 
995 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.79 
 
 
983 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  26.29 
 
 
1001 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.91 
 
 
710 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  25.73 
 
 
1001 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  33.06 
 
 
1446 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  31.44 
 
 
1325 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  33.12 
 
 
1156 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  31.58 
 
 
1175 aa  115  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.45 
 
 
1134 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  30.95 
 
 
1121 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  29.85 
 
 
1154 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  27.17 
 
 
1179 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.67 
 
 
452 aa  94.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 
577 aa  93.2  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  27.83 
 
 
1550 aa  90.5  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.71 
 
 
597 aa  90.5  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.65 
 
 
754 aa  90.5  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  25.82 
 
 
995 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  28.1 
 
 
3506 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.2 
 
 
919 aa  88.6  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.56 
 
 
431 aa  88.2  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 
770 aa  87.4  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.53 
 
 
453 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.82 
 
 
710 aa  86.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  31.6 
 
 
485 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  26.84 
 
 
986 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.73 
 
 
1177 aa  83.2  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
689 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.25 
 
 
1029 aa  83.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  28.12 
 
 
1508 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30 
 
 
1285 aa  82.4  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  34.5 
 
 
683 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  29.72 
 
 
644 aa  82  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  28.82 
 
 
1041 aa  81.6  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  28.82 
 
 
1041 aa  81.6  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  28.71 
 
 
576 aa  81.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.49 
 
 
1361 aa  81.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  29.55 
 
 
533 aa  80.5  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.86 
 
 
816 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.29 
 
 
415 aa  80.9  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.67 
 
 
688 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.41 
 
 
718 aa  80.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.32 
 
 
1782 aa  79.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.39 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00404816  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  25.16 
 
 
1119 aa  77.8  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.69 
 
 
626 aa  77  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.95 
 
 
1253 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.15 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.68 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.43 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2643  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.34 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2753  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.68 
 
 
760 aa  75.1  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.874894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.65 
 
 
500 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.88 
 
 
612 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.79 
 
 
626 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0198  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.43 
 
 
418 aa  73.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.19 
 
 
487 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
453 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263259  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.62 
 
 
1227 aa  73.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 
640 aa  73.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.06 
 
 
848 aa  73.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.55 
 
 
1333 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  37.04 
 
 
652 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.7 
 
 
627 aa  72.4  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  26.55 
 
 
2711 aa  72.4  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5144  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.91 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.3 
 
 
398 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  36.57 
 
 
652 aa  72  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  29.1 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.97 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.17 
 
 
1769 aa  71.6  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  27.67 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>