29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2218 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2218  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1387    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.17 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  35.58 
 
 		 652 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  30.22 
 
 		 641 aa  62  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  35.58 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.48 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  37.91 
 
 		 2057 aa  57.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  32.52 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  32.52 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.63 
 
 		 1322 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 		 2366 aa  54.3  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.01 
 
 		 348 aa  54.3  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  38.55 
 
 		 1177 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  45.35 
 
 		 2371 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  34.09 
 
 		 653 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  35.86 
 
 		 2578 aa  51.6  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  37.74 
 
 		 2906 aa  51.2  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  46.43 
 
 		 3322 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  32.43 
 
 		 683 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.59 
 
 		 3629 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  33.01 
 
 		 1066 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  46.07 
 
 		 2396 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  37.8 
 
 		 3506 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  31.72 
 
 		 422 aa  47.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  32.7 
 
 		 657 aa  47.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  35.67 
 
 		 2711 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.14 
 
 		 1113 aa  46.6  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.12 
 
 		 661 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.88 
 
 		 1011 aa  45.8  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>