144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3319 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2201  serine protease  54.75 
 
 		 641 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  100 
 
 		 634 aa  1280    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  91.17 
 
 		 634 aa  1142    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  53.55 
 
 		 683 aa  601  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  51.68 
 
 		 657 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  52.09 
 
 		 652 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  51.68 
 
 		 653 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  51.68 
 
 		 653 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  52.43 
 
 		 653 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  51.76 
 
 		 652 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  51.52 
 
 		 661 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  42.4 
 
 		 986 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  41.64 
 
 		 995 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  46.91 
 
 		 1053 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  48.85 
 
 		 348 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.11 
 
 		 1011 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  39.56 
 
 		 1177 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  34.65 
 
 		 423 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  35.04 
 
 		 423 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  34.65 
 
 		 423 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.14 
 
 		 425 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.94 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.4 
 
 		 447 aa  125  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.94 
 
 		 431 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.89 
 
 		 378 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.55 
 
 		 947 aa  95.1  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.41 
 
 		 1125 aa  90.9  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.41 
 
 		 472 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.54 
 
 		 510 aa  88.2  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.91 
 
 		 378 aa  87.8  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  35.97 
 
 		 949 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  35.23 
 
 		 998 aa  85.5  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  35.23 
 
 		 970 aa  85.1  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  35.97 
 
 		 970 aa  85.1  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  30.7 
 
 		 1055 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  29.9 
 
 		 1028 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  37.11 
 
 		 974 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  30.13 
 
 		 1038 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  37.91 
 
 		 954 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.09 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  33.97 
 
 		 965 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  33.97 
 
 		 909 aa  75.1  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  30.56 
 
 		 1062 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  37.5 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  32.56 
 
 		 1004 aa  69.7  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  34.98 
 
 		 911 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.62 
 
 		 906 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2218  hypothetical protein  35.17 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  33.6 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  28.33 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.6 
 
 		 926 aa  63.9  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  31.43 
 
 		 942 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  31.36 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.03 
 
 		 915 aa  61.6  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 1006 aa  61.6  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  34 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.69 
 
 		 910 aa  60.5  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  31.13 
 
 		 248 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  34 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  33.11 
 
 		 1033 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  34.38 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.18 
 
 		 3322 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  32 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  34.55 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.84 
 
 		 913 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  49.33 
 
 		 2057 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.96 
 
 		 3391 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  34.34 
 
 		 250 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  47.89 
 
 		 2906 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  47.56 
 
 		 1782 aa  55.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  34.34 
 
 		 250 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  37.27 
 
 		 2578 aa  55.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  34.34 
 
 		 250 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.63 
 
 		 256 aa  55.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  36.63 
 
 		 253 aa  54.7  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.05 
 
 		 171 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  34.34 
 
 		 250 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  34.65 
 
 		 275 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  42.37 
 
 		 295 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  33.33 
 
 		 250 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  34.44 
 
 		 241 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  29.67 
 
 		 265 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.95 
 
 		 979 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  41.67 
 
 		 1550 aa  52.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.83 
 
 		 3629 aa  51.6  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.73 
 
 		 262 aa  51.2  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 169 aa  51.2  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  43.04 
 
 		 1882 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.21 
 
 		 176 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  27.88 
 
 		 292 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.57 
 
 		 187 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  27.88 
 
 		 292 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  29.03 
 
 		 296 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  35.51 
 
 		 3506 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 174 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.86 
 
 		 3089 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  49.09 
 
 		 2711 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 179 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  35.2 
 
 		 1325 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.88 
 
 		 1285 aa  48.9  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>