174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4881 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 2366 aa  4234    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  40.84 
 
 		 3506 aa  740    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  82.74 
 
 		 2396 aa  3229    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  63.85 
 
 		 1508 aa  1226    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  50.3 
 
 		 3954 aa  823    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  50.07 
 
 		 3629 aa  832    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  48.33 
 
 		 4238 aa  1028    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  48.8 
 
 		 3822 aa  1038    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  97.63 
 
 		 2371 aa  3566    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  86.37 
 
 		 2346 aa  3311    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  51.45 
 
 		 4238 aa  1135    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  86.39 
 
 		 2365 aa  3353    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1881 aa  499  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.74 
 
 		 1119 aa  465  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.24 
 
 		 1848 aa  438  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  42.22 
 
 		 2711 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.97 
 
 		 1227 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  40.91 
 
 		 986 aa  391  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  41.22 
 
 		 995 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  38.28 
 
 		 1971 aa  387  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  36.06 
 
 		 2003 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  33.89 
 
 		 1782 aa  387  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.76 
 
 		 1285 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.31 
 
 		 1029 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  34.69 
 
 		 1519 aa  347  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  36.39 
 
 		 650 aa  342  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  38.51 
 
 		 1033 aa  337  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  37.24 
 
 		 1004 aa  329  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  35.17 
 
 		 2906 aa  324  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  37.31 
 
 		 991 aa  305  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  34.65 
 
 		 990 aa  301  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  37.14 
 
 		 995 aa  298  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  32.39 
 
 		 1530 aa  296  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  36.04 
 
 		 1055 aa  295  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  36.69 
 
 		 983 aa  293  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  37.33 
 
 		 1028 aa  291  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  52.37 
 
 		 415 aa  286  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  35.91 
 
 		 1038 aa  284  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.3 
 
 		 919 aa  284  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  37.05 
 
 		 1001 aa  283  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  40.27 
 
 		 1053 aa  281  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  54.82 
 
 		 1550 aa  276  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  35.84 
 
 		 1001 aa  272  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  40.65 
 
 		 1172 aa  272  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  40.09 
 
 		 1459 aa  270  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  32.95 
 
 		 1056 aa  266  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  41.24 
 
 		 1458 aa  266  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.21 
 
 		 972 aa  264  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  34.45 
 
 		 1164 aa  260  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.51 
 
 		 3322 aa  258  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  35.95 
 
 		 985 aa  256  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.84 
 
 		 1011 aa  256  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  34.69 
 
 		 1333 aa  254  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  35.89 
 
 		 994 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  34.2 
 
 		 1129 aa  237  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  34.2 
 
 		 1131 aa  237  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  34.06 
 
 		 1129 aa  235  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  34.06 
 
 		 1131 aa  235  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  34.06 
 
 		 1131 aa  235  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  34.06 
 
 		 1131 aa  235  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  37.23 
 
 		 1130 aa  226  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  33.77 
 
 		 1131 aa  226  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  36.17 
 
 		 980 aa  224  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  36.65 
 
 		 2578 aa  221  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  35.17 
 
 		 1062 aa  210  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  36.03 
 
 		 2407 aa  207  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  33.87 
 
 		 1152 aa  206  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  33.83 
 
 		 1016 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  30.06 
 
 		 677 aa  202  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  30.58 
 
 		 1111 aa  202  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.74 
 
 		 1006 aa  200  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.74 
 
 		 1081 aa  197  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.56 
 
 		 1322 aa  186  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  32.38 
 
 		 2642 aa  180  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.57 
 
 		 1532 aa  179  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  32.08 
 
 		 1011 aa  171  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.06 
 
 		 1125 aa  165  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.66 
 
 		 3420 aa  162  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.79 
 
 		 3415 aa  158  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  35.7 
 
 		 1882 aa  153  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.93 
 
 		 2363 aa  152  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  38.41 
 
 		 3391 aa  144  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.38 
 
 		 1113 aa  144  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  30.53 
 
 		 882 aa  142  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  30.59 
 
 		 1180 aa  141  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  37.74 
 
 		 1130 aa  142  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  41.87 
 
 		 1593 aa  138  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  32.17 
 
 		 816 aa  137  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  33.09 
 
 		 488 aa  136  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  32.63 
 
 		 407 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.34 
 
 		 1694 aa  134  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  35.7 
 
 		 2926 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  37.94 
 
 		 861 aa  115  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27 
 
 		 1741 aa  115  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  30.19 
 
 		 1019 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1300 aa  114  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.22 
 
 		 3089 aa  114  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  40.07 
 
 		 950 aa  112  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.15 
 
 		 1769 aa  110  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28.7 
 
 		 814 aa  108  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>