252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1672 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 3391 aa  6442    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  42.43 
 
 		 2193 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  40.06 
 
 		 1631 aa  419  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  34.32 
 
 		 2890 aa  305  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  69.55 
 
 		 2802 aa  262  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  42.16 
 
 		 5899 aa  241  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.03 
 
 		 3089 aa  221  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  45.56 
 
 		 2132 aa  219  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  46.46 
 
 		 2853 aa  215  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  41.71 
 
 		 1971 aa  212  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  39.01 
 
 		 2001 aa  204  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  48.52 
 
 		 2820 aa  200  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  37.18 
 
 		 2906 aa  192  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.45 
 
 		 3629 aa  186  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  42.63 
 
 		 3132 aa  185  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  36.96 
 
 		 1421 aa  180  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  39.57 
 
 		 3506 aa  175  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.18 
 
 		 5787 aa  174  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  50.31 
 
 		 8871 aa  172  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  39.01 
 
 		 2396 aa  166  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  34.49 
 
 		 1881 aa  157  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  37.2 
 
 		 3420 aa  156  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  52.56 
 
 		 16311 aa  156  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  38.46 
 
 		 2711 aa  154  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  34.15 
 
 		 994 aa  146  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 14916 aa  137  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  43.18 
 
 		 861 aa  137  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  46.31 
 
 		 2133 aa  135  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.09 
 
 		 3363 aa  134  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  38.73 
 
 		 2366 aa  132  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  34.48 
 
 		 1119 aa  132  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  45.45 
 
 		 2461 aa  130  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  34.15 
 
 		 1458 aa  129  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  43.04 
 
 		 1508 aa  128  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  34.27 
 
 		 1323 aa  127  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  29.47 
 
 		 4465 aa  127  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  32.41 
 
 		 3066 aa  126  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.11 
 
 		 3954 aa  125  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1882 aa  124  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  43.54 
 
 		 1838 aa  122  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  40.46 
 
 		 1741 aa  122  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  35.37 
 
 		 6678 aa  120  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  40.14 
 
 		 1019 aa  119  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  33.2 
 
 		 8980 aa  117  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  37.5 
 
 		 2371 aa  117  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.05 
 
 		 1113 aa  116  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  24.66 
 
 		 2656 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  35.95 
 
 		 1111 aa  114  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  34.48 
 
 		 1130 aa  112  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  34.84 
 
 		 1134 aa  112  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  34.06 
 
 		 1530 aa  110  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.09 
 
 		 1532 aa  108  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  42.14 
 
 		 1855 aa  108  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  35.49 
 
 		 2926 aa  108  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  30.52 
 
 		 12741 aa  107  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.03 
 
 		 1227 aa  106  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.76 
 
 		 1081 aa  103  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  35.87 
 
 		 2194 aa  102  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  35.12 
 
 		 938 aa  101  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 4334 aa  100  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  28.17 
 
 		 1867 aa  101  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  39.14 
 
 		 3822 aa  99.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  37.61 
 
 		 1180 aa  99.8  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  36.51 
 
 		 2642 aa  98.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  38.36 
 
 		 940 aa  98.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  34.34 
 
 		 922 aa  98.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 		 3508 aa  96.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.23 
 
 		 3191 aa  95.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  32.93 
 
 		 337 aa  94.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.53 
 
 		 3427 aa  94.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.96 
 
 		 1806 aa  93.6  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  46.3 
 
 		 1359 aa  93.6  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 		 9867 aa  93.6  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1300 aa  93.2  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36.87 
 
 		 1550 aa  92.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.61 
 
 		 2839 aa  92.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  33.94 
 
 		 1782 aa  91.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  40.49 
 
 		 1571 aa  92  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  34.08 
 
 		 1632 aa  91.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  39.67 
 
 		 1202 aa  90.9  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  31.46 
 
 		 852 aa  90.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  36.05 
 
 		 1108 aa  90.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.12 
 
 		 824 aa  89  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  34.83 
 
 		 4723 aa  88.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  39 
 
 		 1099 aa  88.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3714 aa  87  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  47.83 
 
 		 2578 aa  87  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1869 aa  86.7  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  35.05 
 
 		 950 aa  85.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  40.65 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  30.25 
 
 		 4120 aa  83.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  33.05 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.54 
 
 		 1848 aa  82.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  25.34 
 
 		 3259 aa  82.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  42.53 
 
 		 1019 aa  82  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  33.85 
 
 		 3415 aa  82  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.7 
 
 		 1779 aa  81.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  43.66 
 
 		 2365 aa  81.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  43.66 
 
 		 2346 aa  80.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  29.7 
 
 		 426 aa  80.5  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>