299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1339 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 8980 aa  17390    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  36.07 
 
 		 12741 aa  1461    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0652  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1373 aa  243  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0788279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.92 
 
 		 5342 aa  239  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  34.62 
 
 		 15831 aa  191  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  30.61 
 
 		 14829 aa  179  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.16 
 
 		 14916 aa  177  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1047  hypothetical protein  23.26 
 
 		 6062 aa  167  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  33.71 
 
 		 4465 aa  139  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  43.71 
 
 		 1838 aa  135  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  31.4 
 
 		 3132 aa  133  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  47.77 
 
 		 2461 aa  134  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.72 
 
 		 3363 aa  132  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  30.38 
 
 		 2001 aa  131  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  38.57 
 
 		 2132 aa  130  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  40.76 
 
 		 1019 aa  131  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  39.75 
 
 		 2133 aa  130  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  43.48 
 
 		 16311 aa  129  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.2 
 
 		 3391 aa  127  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  41.08 
 
 		 1855 aa  125  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  44.3 
 
 		 8871 aa  123  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  45.58 
 
 		 3954 aa  123  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  39.43 
 
 		 2820 aa  123  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  36.36 
 
 		 337 aa  122  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  42.11 
 
 		 6678 aa  121  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  41.03 
 
 		 2853 aa  120  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 3427 aa  119  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.79 
 
 		 4334 aa  114  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.81 
 
 		 3089 aa  109  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  35.88 
 
 		 922 aa  107  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.47 
 
 		 824 aa  105  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.6 
 
 		 3066 aa  104  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  49.64 
 
 		 492 aa  103  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  36.48 
 
 		 938 aa  102  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0616  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.25 
 
 		 20646 aa  101  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  37.16 
 
 		 3714 aa  100  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  37.42 
 
 		 940 aa  99.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1154  surface protein  27.59 
 
 		 4713 aa  97.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 		 1022 aa  97.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 		 1017 aa  96.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 		 9867 aa  94.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  29.54 
 
 		 3508 aa  93.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  33.77 
 
 		 426 aa  92.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1424 aa  89  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.18 
 
 		 2802 aa  87.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  37.4 
 
 		 3193 aa  87.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.38 
 
 		 980 aa  84.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  38.74 
 
 		 946 aa  84.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.17 
 
 		 2105 aa  83.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2196  hemolysin-type calcium-binding region  23.31 
 
 		 15245 aa  81.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  34.25 
 
 		 424 aa  80.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  29.19 
 
 		 917 aa  80.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.41 
 
 		 1795 aa  79.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34 
 
 		 1279 aa  78.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  33.59 
 
 		 6581 aa  77  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  46.39 
 
 		 5218 aa  75.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  34.92 
 
 		 460 aa  74.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.69 
 
 		 2667 aa  74.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  46.39 
 
 		 8682 aa  73.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.67 
 
 		 421 aa  73.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.86 
 
 		 5962 aa  73.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  35.68 
 
 		 491 aa  73.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  33.04 
 
 		 2954 aa  73.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.85 
 
 		 982 aa  73.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  46.39 
 
 		 9030 aa  72.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  33.81 
 
 		 686 aa  72.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  44.33 
 
 		 6753 aa  71.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  39.53 
 
 		 4678 aa  71.2  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.96 
 
 		 1499 aa  70.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  36.68 
 
 		 1164 aa  70.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  30.66 
 
 		 615 aa  70.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  42.74 
 
 		 589 aa  69.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  36.11 
 
 		 639 aa  69.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.42 
 
 		 5171 aa  69.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  34.98 
 
 		 1156 aa  68.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.43 
 
 		 1363 aa  68.6  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  37.88 
 
 		 606 aa  68.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.93 
 
 		 2542 aa  68.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  39.34 
 
 		 709 aa  68.6  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.21 
 
 		 577 aa  67.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  29.73 
 
 		 4120 aa  67.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  29.06 
 
 		 724 aa  67.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  32.07 
 
 		 613 aa  67.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  44.79 
 
 		 1594 aa  67.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.19 
 
 		 4106 aa  67  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.55 
 
 		 1963 aa  67  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 		 572 aa  67  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  44.12 
 
 		 1526 aa  66.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  42.48 
 
 		 260 aa  65.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.66 
 
 		 588 aa  65.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 744 aa  65.1  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  37.22 
 
 		 385 aa  65.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 		 1534 aa  65.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 2346 aa  65.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  38.05 
 
 		 2885 aa  65.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  29.76 
 
 		 3954 aa  65.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 1383 aa  65.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.08 
 
 		 2668 aa  65.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  34.76 
 
 		 243 aa  64.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  39.29 
 
 		 1197 aa  64.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>