46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0246 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  859    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  36.65 
 
 		 6678 aa  116  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  34.68 
 
 		 1838 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.54 
 
 		 8871 aa  106  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  34.34 
 
 		 2461 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  31.93 
 
 		 3132 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.62 
 
 		 1019 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 		 1855 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  34.72 
 
 		 2132 aa  96.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.13 
 
 		 4334 aa  96.3  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  29.9 
 
 		 2133 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  37.14 
 
 		 2820 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  31.9 
 
 		 2001 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.86 
 
 		 3363 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  39.17 
 
 		 8980 aa  90.5  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.39 
 
 		 14916 aa  90.1  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  36.64 
 
 		 12741 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  28.4 
 
 		 4465 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  30.94 
 
 		 2853 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  34.03 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.03 
 
 		 3427 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  34.48 
 
 		 940 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  30.71 
 
 		 3954 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 		 3508 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  29.7 
 
 		 3391 aa  80.5  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  34.48 
 
 		 938 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 		 3066 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  27.33 
 
 		 4120 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.14 
 
 		 16311 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.22 
 
 		 3089 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  30.71 
 
 		 922 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  38.57 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  25.76 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.53 
 
 		 813 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  27.43 
 
 		 1017 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  27.43 
 
 		 1022 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 		 3193 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  26.06 
 
 		 3714 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 		 9867 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.58 
 
 		 2802 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  28.29 
 
 		 2024 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  31.64 
 
 		 917 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  27.59 
 
 		 3834 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.49 
 
 		 2296 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  35 
 
 		 1323 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  26.38 
 
 		 7284 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>