107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1235 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 2024 aa  3982    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  46.34 
 
 		 3834 aa  870    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  47.81 
 
 		 2345 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  37.67 
 
 		 4120 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  44.6 
 
 		 1838 aa  335  7.000000000000001e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1013 aa  300  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  35.25 
 
 		 1557 aa  259  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1933 aa  223  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  37.66 
 
 		 4379 aa  199  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  38.59 
 
 		 1025 aa  198  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  32.78 
 
 		 904 aa  179  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  40.8 
 
 		 3608 aa  164  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.58 
 
 		 3619 aa  159  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.46 
 
 		 3619 aa  158  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  33.84 
 
 		 808 aa  154  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.11 
 
 		 2713 aa  127  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  31.92 
 
 		 910 aa  124  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  46.76 
 
 		 1126 aa  123  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  25.85 
 
 		 2461 aa  116  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  54.95 
 
 		 3977 aa  112  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  38.89 
 
 		 1554 aa  111  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  44.35 
 
 		 692 aa  102  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  37.02 
 
 		 2950 aa  97.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  42.86 
 
 		 2852 aa  97.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  28.35 
 
 		 496 aa  92  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  31.89 
 
 		 7284 aa  89  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  42.14 
 
 		 2182 aa  87.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  25.08 
 
 		 4661 aa  86.7  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  36.84 
 
 		 1587 aa  83.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  22.81 
 
 		 1507 aa  80.1  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.63 
 
 		 3544 aa  79  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  44 
 
 		 1289 aa  76.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  34.59 
 
 		 637 aa  76.3  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  27.49 
 
 		 4231 aa  76.3  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  30.61 
 
 		 3508 aa  72.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  25.8 
 
 		 8321 aa  70.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 818 aa  70.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  32.87 
 
 		 2132 aa  70.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.15 
 
 		 2656 aa  69.7  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  29.13 
 
 		 560 aa  69.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1969 aa  68.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  26.25 
 
 		 938 aa  67  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  24.81 
 
 		 3793 aa  65.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  34.75 
 
 		 4697 aa  65.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  34.25 
 
 		 693 aa  65.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  40.54 
 
 		 1827 aa  65.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  28.29 
 
 		 426 aa  64.7  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1634 aa  64.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 		 2796 aa  63.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  31.69 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  26.22 
 
 		 1855 aa  62.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1329 aa  62.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  32.14 
 
 		 3714 aa  62.4  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  27.5 
 
 		 4334 aa  62  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  25.81 
 
 		 3089 aa  61.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  26.43 
 
 		 2133 aa  61.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  26.43 
 
 		 3132 aa  61.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  25.79 
 
 		 940 aa  60.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.73 
 
 		 1884 aa  59.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  33.86 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.69 
 
 		 16311 aa  59.3  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  25.15 
 
 		 2802 aa  58.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  24.11 
 
 		 1019 aa  57.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2801  dystroglycan-type cadherin-like  40.74 
 
 		 671 aa  57.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000577586  decreased coverage  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.06 
 
 		 1607 aa  57.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.2 
 
 		 3699 aa  57  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.33 
 
 		 8871 aa  56.6  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  25.87 
 
 		 3066 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.77 
 
 		 2839 aa  56.2  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  27.18 
 
 		 3699 aa  55.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.23 
 
 		 1372 aa  55.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.87 
 
 		 2853 aa  55.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 		 995 aa  54.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  33.91 
 
 		 861 aa  54.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  27.09 
 
 		 2416 aa  53.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  25.35 
 
 		 3391 aa  53.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09720  hypothetical protein  28.44 
 
 		 704 aa  53.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.506636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  23.78 
 
 		 3954 aa  53.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  35.92 
 
 		 4723 aa  52.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  23.1 
 
 		 587 aa  51.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  28.33 
 
 		 799 aa  50.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  23.19 
 
 		 9867 aa  50.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.34 
 
 		 3427 aa  50.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  31.45 
 
 		 1288 aa  50.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  24.44 
 
 		 922 aa  50.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  27.79 
 
 		 2625 aa  50.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  26.63 
 
 		 2820 aa  50.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  26.75 
 
 		 12741 aa  50.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  29.81 
 
 		 1315 aa  49.7  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  21.99 
 
 		 824 aa  49.3  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  24.12 
 
 		 337 aa  48.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 1284 aa  48.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  33.33 
 
 		 2342 aa  48.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  33.33 
 
 		 2342 aa  48.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  27.35 
 
 		 8980 aa  48.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 685 aa  47.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.01 
 
 		 1052 aa  48.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  29.23 
 
 		 766 aa  47.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  39.47 
 
 		 1650 aa  47  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  28.27 
 
 		 5899 aa  46.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>