26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1638 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  100 
 
 		 861 aa  1730    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1640  hypothetical protein  48.19 
 
 		 662 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.157145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2670  hypothetical protein  35.16 
 
 		 644 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1839  hypothetical protein  29.16 
 
 		 723 aa  218  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2439  hypothetical protein  28.04 
 
 		 711 aa  204  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2163  hypothetical protein  28.02 
 
 		 710 aa  196  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.610814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2533  hypothetical protein  33.6 
 
 		 894 aa  171  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707593  normal  0.684993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18880  hypothetical protein  23.18 
 
 		 686 aa  108  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02954  extracellular serine-rich protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07870)  22 
 
 		 912 aa  95.1  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0326959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  43.27 
 
 		 904 aa  93.2  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1820  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 699 aa  84.7  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0873981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  37.93 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  37.72 
 
 		 910 aa  71.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  36.14 
 
 		 808 aa  68.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  47.87 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  35.84 
 
 		 3834 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  38.46 
 
 		 818 aa  65.1  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  35.63 
 
 		 2024 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  35.34 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  37.08 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  43.42 
 
 		 628 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 2345 aa  52.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1554  hypothetical protein  33.66 
 
 		 618 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842848  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  32.53 
 
 		 1554 aa  48.9  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1126 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1976 aa  44.3  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>