38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0719 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  100 
 
 		 818 aa  1597    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  47.87 
 
 		 904 aa  299  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  46.05 
 
 		 808 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  35.19 
 
 		 910 aa  177  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  43.03 
 
 		 560 aa  173  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  35.09 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  33.07 
 
 		 3834 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  42.27 
 
 		 637 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  31.27 
 
 		 587 aa  107  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  33.19 
 
 		 2024 aa  107  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  39.76 
 
 		 577 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  32.55 
 
 		 2345 aa  91.3  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09720  hypothetical protein  29.49 
 
 		 704 aa  74.7  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.506636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  29.53 
 
 		 4120 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  38.46 
 
 		 861 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  50.77 
 
 		 848 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  28.71 
 
 		 1554 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  30.92 
 
 		 1657 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4852  hypothetical protein  31.52 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2076  hypothetical protein  29.17 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1329 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  29.39 
 
 		 2318 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  35.56 
 
 		 1288 aa  58.9  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  37.61 
 
 		 570 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1976 aa  57.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  35.5 
 
 		 1108 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  39.34 
 
 		 228 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.46 
 
 		 1507 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.16 
 
 		 2713 aa  52.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.49 
 
 		 3793 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1792  hypothetical protein  34.78 
 
 		 932 aa  51.6  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000052319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  28.51 
 
 		 1518 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1059 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  38.79 
 
 		 1231 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  40.32 
 
 		 1289 aa  45.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1351 aa  44.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  25.91 
 
 		 925 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30 
 
 		 1002 aa  44.3  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>