99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1404 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  100 
 
 
1231 aa  2427    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  44.44 
 
 
1089 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 
2346 aa  218  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7459  hypothetical protein  35.51 
 
 
826 aa  181  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240347  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.29 
 
 
3977 aa  172  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  33.19 
 
 
1225 aa  168  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33840  hypothetical protein  36.05 
 
 
1001 aa  162  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263623  normal  0.727273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  31.73 
 
 
319 aa  125  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  35.29 
 
 
1426 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  34.41 
 
 
343 aa  101  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3716  hypothetical protein  32.3 
 
 
339 aa  92  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2655  hypothetical protein  31.63 
 
 
342 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  35.64 
 
 
1085 aa  91.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3349  hypothetical protein  33.86 
 
 
328 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  26.14 
 
 
766 aa  85.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  25.73 
 
 
755 aa  84.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.08 
 
 
1088 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  25.31 
 
 
760 aa  81.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  25.2 
 
 
760 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  25.64 
 
 
766 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  25.5 
 
 
772 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  29.41 
 
 
772 aa  79.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  24.9 
 
 
779 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  24.9 
 
 
765 aa  79.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  30.35 
 
 
586 aa  78.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  29.78 
 
 
1070 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  29.78 
 
 
1070 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  34.39 
 
 
1421 aa  76.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  37.7 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  27.69 
 
 
954 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  27.27 
 
 
1012 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  36.02 
 
 
616 aa  72.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  33.97 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  32.03 
 
 
789 aa  72  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  32.03 
 
 
789 aa  72  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  26.11 
 
 
542 aa  72  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.68 
 
 
1112 aa  71.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  35.38 
 
 
284 aa  71.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  30.35 
 
 
643 aa  71.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.27 
 
 
348 aa  70.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.27 
 
 
348 aa  70.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30 
 
 
1052 aa  69.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  29.81 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  33.59 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  35.15 
 
 
663 aa  67.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  26.94 
 
 
995 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  24.81 
 
 
994 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  31.25 
 
 
644 aa  64.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  37.41 
 
 
699 aa  63.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  28.57 
 
 
531 aa  63.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  34.82 
 
 
993 aa  63.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  39.84 
 
 
681 aa  62.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  27.33 
 
 
399 aa  62.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  38.68 
 
 
490 aa  62.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  29.91 
 
 
685 aa  62  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  33.1 
 
 
558 aa  62  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  27.75 
 
 
197 aa  61.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  35.92 
 
 
1351 aa  61.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  30.08 
 
 
1011 aa  60.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  27.13 
 
 
858 aa  60.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.28 
 
 
637 aa  58.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.53 
 
 
877 aa  57  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3822  hypothetical protein  26.64 
 
 
310 aa  57  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  36.96 
 
 
1290 aa  57.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.79 
 
 
1107 aa  55.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  26.55 
 
 
498 aa  55.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  29.29 
 
 
400 aa  55.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.23 
 
 
355 aa  55.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  28.81 
 
 
565 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.25 
 
 
1266 aa  54.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  29.03 
 
 
384 aa  54.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  25.1 
 
 
356 aa  54.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  27.37 
 
 
692 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  28.42 
 
 
307 aa  53.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.75 
 
 
400 aa  52.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  31.58 
 
 
400 aa  52.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  41.18 
 
 
366 aa  52.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  41.05 
 
 
730 aa  51.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  28.69 
 
 
399 aa  50.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  31.07 
 
 
2082 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.61 
 
 
726 aa  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  45.83 
 
 
2914 aa  49.3  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  38.18 
 
 
1424 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.57 
 
 
1041 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  47.83 
 
 
2851 aa  49.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.34 
 
 
892 aa  49.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  38.95 
 
 
607 aa  48.9  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  44.59 
 
 
523 aa  48.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  37.93 
 
 
1370 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  36.94 
 
 
772 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  26.06 
 
 
399 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  29.03 
 
 
400 aa  47.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
582 aa  45.8  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  30.36 
 
 
401 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  52.73 
 
 
582 aa  45.8  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
587 aa  45.1  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4540  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  45.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  33.33 
 
 
205 aa  45.1  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  34.38 
 
 
863 aa  44.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>