15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3220 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3822  hypothetical protein  74.35 
 
 		 310 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  28.63 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2655  hypothetical protein  35.47 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  34.17 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3716  hypothetical protein  31.64 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3349  hypothetical protein  33.65 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  27.63 
 
 		 1225 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33840  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1001 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263623  normal  0.727273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.69 
 
 		 2346 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.05 
 
 		 3977 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  35.48 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1231 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  27.83 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  29.65 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>