18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33840  hypothetical protein  100 
 
 		 1001 aa  1903    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263623  normal  0.727273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7459  hypothetical protein  32.92 
 
 		 826 aa  281  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240347  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  37.33 
 
 		 1089 aa  219  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.56 
 
 		 2346 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  36.24 
 
 		 1231 aa  167  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.81 
 
 		 3977 aa  164  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  29.05 
 
 		 1225 aa  134  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  30.56 
 
 		 862 aa  104  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  29.06 
 
 		 319 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3716  hypothetical protein  30.82 
 
 		 339 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3349  hypothetical protein  31.93 
 
 		 328 aa  90.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  30.18 
 
 		 343 aa  89.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2655  hypothetical protein  31.92 
 
 		 342 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  38.81 
 
 		 307 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.83 
 
 		 2068 aa  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.5 
 
 		 916 aa  48.9  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3822  hypothetical protein  31.34 
 
 		 310 aa  45.8  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2876  hypothetical protein  41.54 
 
 		 365 aa  45.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>