161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1067 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 1089 aa  2090    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  44.58 
 
 		 1231 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7459  hypothetical protein  42.86 
 
 		 826 aa  283  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240347  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.28 
 
 		 2346 aa  251  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33840  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1001 aa  202  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263623  normal  0.727273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  32.25 
 
 		 1225 aa  164  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 3977 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  39.22 
 
 		 1426 aa  148  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  44.87 
 
 		 1421 aa  118  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1170 aa  99  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  27.69 
 
 		 319 aa  97.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3716  hypothetical protein  31.06 
 
 		 339 aa  91.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  43.45 
 
 		 644 aa  89.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2655  hypothetical protein  33.75 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  31.27 
 
 		 343 aa  83.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  53.06 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  38.31 
 
 		 663 aa  76.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3349  hypothetical protein  32.69 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  52.17 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  55.42 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  57.83 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  47.46 
 
 		 439 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  55.42 
 
 		 437 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50.54 
 
 		 2914 aa  73.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  55.42 
 
 		 437 aa  73.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  47.46 
 
 		 437 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  29.63 
 
 		 717 aa  71.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  50 
 
 		 2851 aa  69.7  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  45.61 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  54.76 
 
 		 645 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  37.19 
 
 		 283 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  50.59 
 
 		 344 aa  67  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  50.6 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.86 
 
 		 689 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  57.78 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  60.61 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.89 
 
 		 415 aa  63.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  31.19 
 
 		 586 aa  63.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  44.09 
 
 		 523 aa  63.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  35.34 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  37.93 
 
 		 366 aa  62  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  50 
 
 		 481 aa  62  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  50 
 
 		 478 aa  62  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.53 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  31.19 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1477  hypothetical protein  31.76 
 
 		 330 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  45.24 
 
 		 400 aa  60.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  49.4 
 
 		 585 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  50.57 
 
 		 813 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  24.25 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  38.89 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.71 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  51.14 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  50 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  39.32 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  50 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  33.52 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1667 aa  58.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  54.44 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  45.12 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  27.76 
 
 		 580 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  44.66 
 
 		 582 aa  58.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  34.5 
 
 		 303 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  48.24 
 
 		 643 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  28.57 
 
 		 819 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  44.66 
 
 		 587 aa  57  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.15 
 
 		 616 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.43 
 
 		 366 aa  56.2  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.57 
 
 		 1189 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  45 
 
 		 380 aa  56.2  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  58.18 
 
 		 158 aa  55.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  47.25 
 
 		 322 aa  55.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  49.41 
 
 		 712 aa  55.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  41 
 
 		 436 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.34 
 
 		 335 aa  55.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  49.44 
 
 		 606 aa  55.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  44.71 
 
 		 473 aa  55.5  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.51 
 
 		 362 aa  55.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  46.24 
 
 		 492 aa  54.3  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  59.62 
 
 		 221 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.08 
 
 		 726 aa  54.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.46 
 
 		 327 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  37.04 
 
 		 1101 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.23 
 
 		 334 aa  54.3  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  35.66 
 
 		 295 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.2 
 
 		 362 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  49.41 
 
 		 706 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  37.09 
 
 		 308 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  50.65 
 
 		 951 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  49.35 
 
 		 934 aa  53.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  44.57 
 
 		 936 aa  52.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  43.68 
 
 		 319 aa  52.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.56 
 
 		 384 aa  52.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  45.78 
 
 		 842 aa  52.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  45.78 
 
 		 474 aa  52.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.4 
 
 		 335 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.18 
 
 		 338 aa  52.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  35.07 
 
 		 681 aa  52  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>