17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2655 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2655  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3716  hypothetical protein  71.14 
 
 
339 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  35.47 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  41.21 
 
 
343 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.08 
 
 
3977 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.61 
 
 
2346 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3349  hypothetical protein  36.69 
 
 
328 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33840  hypothetical protein  33.22 
 
 
1001 aa  96.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263623  normal  0.727273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  31.63 
 
 
1231 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  31.08 
 
 
1089 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 
1225 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3822  hypothetical protein  31.53 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7459  hypothetical protein  27.33 
 
 
826 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240347  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  30.31 
 
 
340 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  29.39 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  26.72 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>