15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4005 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  741    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  33.69 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  31.95 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  32.34 
 
 		 340 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  28.13 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  30.45 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  28.19 
 
 		 382 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  26.83 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  30.1 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  26.34 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  29.91 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  26.8 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 523 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  30.41 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  34.62 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>