14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1738 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  780    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  42.12 
 
 
355 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  43.75 
 
 
371 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  39.41 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
523 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  40.11 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  37.6 
 
 
369 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  31.4 
 
 
320 aa  106  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  25.09 
 
 
335 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  26.83 
 
 
370 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  27.82 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  26.56 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  22.82 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  33.06 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>