15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1724 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  100 
 
 
362 aa  712    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  44.1 
 
 
358 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  40.97 
 
 
371 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  39.58 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  42.82 
 
 
523 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  40.11 
 
 
383 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  42.18 
 
 
369 aa  189  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  28.87 
 
 
320 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  28.9 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  31.25 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  28.94 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  28 
 
 
358 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  29.48 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  30.31 
 
 
370 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>