14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0340 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  48.21 
 
 
371 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  44.23 
 
 
358 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  42.12 
 
 
383 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  44.55 
 
 
523 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  40.97 
 
 
369 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  39.58 
 
 
362 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  32.55 
 
 
320 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  27.64 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  26.34 
 
 
370 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  26.17 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  26.82 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  28.91 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>