13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4234 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  711    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  56.76 
 
 
358 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  52.02 
 
 
523 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  47.72 
 
 
371 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  40.97 
 
 
355 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  37.6 
 
 
383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  42.18 
 
 
362 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  32.57 
 
 
320 aa  106  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  28.36 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  34.38 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  30.43 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  27.67 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  27.62 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>