15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1710 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  38.44 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  33.94 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  34.11 
 
 		 370 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  29.65 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  29.94 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  26.69 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  31.27 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  30.11 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  28.52 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  25.09 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  27.64 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  35.48 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  27.54 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  28.47 
 
 		 362 aa  46.2  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>