17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4540 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4540  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  361  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2920  hypothetical protein  37.58 
 
 
214 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000251887  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  50 
 
 
2851 aa  46.6  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
582 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  50 
 
 
451 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  50 
 
 
437 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  70.97 
 
 
1101 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  50 
 
 
437 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  42.86 
 
 
342 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  60.53 
 
 
1426 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  51.28 
 
 
582 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  48 
 
 
438 aa  41.6  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  48 
 
 
439 aa  41.2  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  51.28 
 
 
587 aa  41.2  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  41.18 
 
 
645 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  48 
 
 
437 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  43.86 
 
 
616 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>