82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1193 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  100 
 
 		 400 aa  801    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  63.07 
 
 		 400 aa  518  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  64.07 
 
 		 400 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  64.07 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  60.2 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  58.6 
 
 		 399 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  58.04 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  37.67 
 
 		 1085 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.08 
 
 		 760 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.81 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.72 
 
 		 779 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.72 
 
 		 765 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.54 
 
 		 542 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  26.72 
 
 		 772 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26.58 
 
 		 760 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.97 
 
 		 766 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  28.14 
 
 		 995 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  30.54 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  26.69 
 
 		 766 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1351 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  27.14 
 
 		 1070 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  27.14 
 
 		 1070 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.99 
 
 		 1266 aa  96.3  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  27.14 
 
 		 1112 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.98 
 
 		 772 aa  96.3  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.38 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  26.27 
 
 		 755 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.02 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.02 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  27.6 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  25.55 
 
 		 565 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.46 
 
 		 1088 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  25.29 
 
 		 954 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  25.29 
 
 		 1012 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  32.28 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1052 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  33.17 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  24.09 
 
 		 994 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  22.58 
 
 		 993 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  25.73 
 
 		 643 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  24.09 
 
 		 1011 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  27.05 
 
 		 789 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  27.05 
 
 		 789 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.41 
 
 		 877 aa  70.1  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.05 
 
 		 858 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  31.25 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  29 
 
 		 692 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  25.32 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.84 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  28.77 
 
 		 718 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  26.7 
 
 		 1290 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  31.18 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1231 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  34.13 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.37 
 
 		 863 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  29.26 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  32.12 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  32.54 
 
 		 205 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  34.78 
 
 		 197 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.87 
 
 		 1107 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2263  hypothetical protein  29.32 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5088  internalin G  28.57 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0153  internalin G  31.33 
 
 		 267 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  31.16 
 
 		 238 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.56 
 
 		 1086 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  26.55 
 
 		 452 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.23 
 
 		 1655 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05535  hypothetical protein  30.26 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164365  normal  0.982947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2618  hypothetical protein  26.63 
 
 		 165 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  31.58 
 
 		 631 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  31.4 
 
 		 523 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  32.26 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  27.52 
 
 		 279 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  30 
 
 		 254 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  25.68 
 
 		 1780 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  34.55 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  20.92 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  25.36 
 
 		 765 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  22.99 
 
 		 1335 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.93 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  26.83 
 
 		 621 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  28.46 
 
 		 486 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>