35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1105 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0153  internalin G  29.55 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5088  internalin G  30 
 
 		 267 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  90.1  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  26.63 
 
 		 238 aa  86.7  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  29.9 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  32.88 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1085 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  27.66 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1351 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  30.49 
 
 		 467 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05535  hypothetical protein  30.88 
 
 		 174 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164365  normal  0.982947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  30.16 
 
 		 858 aa  53.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  29.32 
 
 		 498 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.28 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  30.15 
 
 		 772 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  32.41 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  30.67 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  32.12 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  30.65 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  25.98 
 
 		 772 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  23.86 
 
 		 765 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  23.86 
 
 		 779 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  26.13 
 
 		 995 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1052 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  28.93 
 
 		 1070 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0953  hypothetical protein  28.95 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  28.93 
 
 		 1112 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  28.93 
 
 		 1070 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  25.15 
 
 		 399 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.08 
 
 		 877 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  23.86 
 
 		 542 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  22.84 
 
 		 755 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  22.84 
 
 		 766 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  27.78 
 
 		 400 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>