143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2223 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  38.25 
 
 
348 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  37.5 
 
 
348 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  39.35 
 
 
341 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  40.84 
 
 
1266 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  34.39 
 
 
760 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  39.18 
 
 
542 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  39.18 
 
 
765 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  39.18 
 
 
779 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  33.6 
 
 
760 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  34.49 
 
 
772 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.77 
 
 
1107 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  38.66 
 
 
766 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  34.62 
 
 
755 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  38.66 
 
 
772 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  38.43 
 
 
531 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  36.82 
 
 
1112 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  29.58 
 
 
1085 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  31.77 
 
 
766 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  31.36 
 
 
643 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  36.63 
 
 
1070 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  36.63 
 
 
1070 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  32.3 
 
 
1088 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  27.76 
 
 
421 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  31.78 
 
 
995 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  32.74 
 
 
355 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.17 
 
 
1351 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  31.98 
 
 
789 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  31.98 
 
 
789 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  35.12 
 
 
498 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.94 
 
 
1041 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  38.76 
 
 
384 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  31.25 
 
 
994 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  28.09 
 
 
399 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  31.86 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  34.91 
 
 
858 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  34.84 
 
 
1052 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  30.94 
 
 
954 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.21 
 
 
1263 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  30.49 
 
 
1012 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  30.49 
 
 
993 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  33.82 
 
 
1011 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  29.46 
 
 
467 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  27.71 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  28.39 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  37.71 
 
 
1015 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  30.69 
 
 
400 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  27.54 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  28.72 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.2 
 
 
863 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  34.98 
 
 
565 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  29.79 
 
 
718 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  32.28 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.22 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  30.22 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  40 
 
 
587 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  30.49 
 
 
539 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  35.9 
 
 
1231 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  30.74 
 
 
877 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.85 
 
 
867 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  33.33 
 
 
1744 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  31.87 
 
 
1335 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  30.74 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.75 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.12 
 
 
2132 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.36 
 
 
892 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  28.21 
 
 
523 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  44.94 
 
 
197 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  34.23 
 
 
692 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  31.78 
 
 
452 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  27.59 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  38.4 
 
 
205 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  24.06 
 
 
935 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.37 
 
 
937 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  28.82 
 
 
937 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  35.74 
 
 
816 aa  59.3  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  32.31 
 
 
1749 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  28.44 
 
 
2491 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.83 
 
 
637 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  35.05 
 
 
1290 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  29.97 
 
 
400 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  28.11 
 
 
312 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.58 
 
 
886 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  28.77 
 
 
508 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  27.04 
 
 
535 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  35.54 
 
 
1370 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  27.51 
 
 
238 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  30.43 
 
 
571 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.72 
 
 
713 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  31.33 
 
 
277 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.61 
 
 
467 aa  53.5  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  31.82 
 
 
1344 aa  52.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  28.92 
 
 
1395 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  28.97 
 
 
581 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  34.83 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  27.08 
 
 
1780 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.98 
 
 
472 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  27.23 
 
 
528 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  31.96 
 
 
543 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  30.15 
 
 
586 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>