62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3631 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1199    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  61.6 
 
 		 581 aa  728    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  55.75 
 
 		 479 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  47.07 
 
 		 473 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  133  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  38.71 
 
 		 484 aa  130  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  31.58 
 
 		 618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  37.95 
 
 		 816 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  27.55 
 
 		 401 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  34.57 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  31.71 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1389 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  28.9 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  33.5 
 
 		 428 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.18 
 
 		 1679 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  30.35 
 
 		 631 aa  100  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  38.64 
 
 		 1059 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  29.74 
 
 		 386 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  31.13 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  30.84 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  30.98 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05536  hypothetical protein  32.14 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  29.7 
 
 		 419 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  28.57 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  31.43 
 
 		 273 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  32.41 
 
 		 191 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.86 
 
 		 476 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.58 
 
 		 1041 aa  60.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  29.39 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  31.2 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  26.11 
 
 		 755 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.95 
 
 		 863 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04856  hypothetical protein  28.87 
 
 		 164 aa  54.7  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  31.88 
 
 		 788 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  27.54 
 
 		 755 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  27.54 
 
 		 755 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  31.88 
 
 		 788 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  27.27 
 
 		 731 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  31.88 
 
 		 788 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.27 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  25.12 
 
 		 765 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.09 
 
 		 772 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  26.91 
 
 		 643 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  29.66 
 
 		 431 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  29.66 
 
 		 443 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  29 
 
 		 615 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  29.66 
 
 		 443 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.56 
 
 		 892 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  27.44 
 
 		 535 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  29.58 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  26.98 
 
 		 692 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  30.77 
 
 		 692 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  34.65 
 
 		 434 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  26.44 
 
 		 418 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.45 
 
 		 508 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0577  hypothetical protein  27.19 
 
 		 229 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  33.13 
 
 		 972 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01429  hypothetical protein  28.81 
 
 		 318 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  27.06 
 
 		 419 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01441  hypothetical protein  28.81 
 
 		 318 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.82 
 
 		 886 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.85 
 
 		 1263 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>