142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0782 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 535 aa  1085    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  31.54 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  28.47 
 
 		 539 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  31.42 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  25.93 
 
 		 528 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  32.11 
 
 		 581 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  25 
 
 		 1266 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  27.61 
 
 		 763 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  30.92 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  25.82 
 
 		 760 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  24.88 
 
 		 766 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.53 
 
 		 508 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  29.9 
 
 		 242 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.02 
 
 		 1041 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  31.84 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.36 
 
 		 1015 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  39.62 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  36.08 
 
 		 713 aa  64.7  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  24.41 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  33.86 
 
 		 788 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  33.86 
 
 		 788 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.82 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  23.47 
 
 		 755 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  23.94 
 
 		 766 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1059 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  32.19 
 
 		 479 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  26.55 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  34.31 
 
 		 863 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.43 
 
 		 1107 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  32.41 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  23.47 
 
 		 765 aa  61.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  23.47 
 
 		 779 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  23.47 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  23 
 
 		 772 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  26.07 
 
 		 1263 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  32.77 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  25.23 
 
 		 1070 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29.05 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  25.23 
 
 		 1070 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  28.26 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.9 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  25.23 
 
 		 1112 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  29.61 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  32.18 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  26.22 
 
 		 1335 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  25.14 
 
 		 772 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  22.22 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1389 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  31.35 
 
 		 279 aa  57  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  31.36 
 
 		 301 aa  57  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  27.04 
 
 		 347 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  31.19 
 
 		 631 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  23.71 
 
 		 1088 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  32.48 
 
 		 776 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  29.89 
 
 		 765 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  27.35 
 
 		 374 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  29.31 
 
 		 755 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30.72 
 
 		 755 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30.72 
 
 		 755 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30.72 
 
 		 731 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 475 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  23.19 
 
 		 789 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  23.19 
 
 		 789 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 459 aa  54.7  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.36 
 
 		 892 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 450 aa  53.5  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 439 aa  53.5  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1744 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  33.11 
 
 		 443 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  21.15 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  24.07 
 
 		 499 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.53 
 
 		 1679 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  31.07 
 
 		 618 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  29.01 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.32 
 
 		 1749 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  24.29 
 
 		 1290 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  31.05 
 
 		 622 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  28.95 
 
 		 586 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  27.98 
 
 		 1024 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.43 
 
 		 877 aa  50.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  30.23 
 
 		 615 aa  50.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  24.32 
 
 		 643 aa  50.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  29.22 
 
 		 954 aa  50.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30 
 
 		 886 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  28.57 
 
 		 490 aa  50.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 447 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1052 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  23.91 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  18.68 
 
 		 995 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  30.48 
 
 		 318 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  27.31 
 
 		 581 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  28.65 
 
 		 972 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28 
 
 		 296 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  26.83 
 
 		 384 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  26.16 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  25.32 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1351 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>