38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1110 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  100 
 
 		 439 aa  871    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  30.8 
 
 		 618 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.26 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  31 
 
 		 631 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.65 
 
 		 1679 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  33.33 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  26.11 
 
 		 424 aa  87  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  31.13 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  31.22 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  30.88 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  32.46 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1389 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  30.13 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  32.7 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  35.44 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  29.23 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  28.84 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1059 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  27.38 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  26.88 
 
 		 816 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  28.03 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  27.82 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  27.49 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  26.52 
 
 		 766 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  27.87 
 
 		 755 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  31.43 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  26.29 
 
 		 772 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.29 
 
 		 765 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  30.46 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  25.94 
 
 		 760 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.29 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  30.41 
 
 		 581 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  23.08 
 
 		 354 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  35.83 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  30.8 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  25.48 
 
 		 760 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.48 
 
 		 542 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  40.82 
 
 		 1088 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>