102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0744 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 622 aa  1271    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  82.68 
 
 		 615 aa  1006    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  89.68 
 
 		 318 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  39.07 
 
 		 755 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  39.07 
 
 		 731 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  39.07 
 
 		 755 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  39.39 
 
 		 755 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  70.33 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  71.48 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  37.21 
 
 		 765 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  38.92 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  40.79 
 
 		 788 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  40.95 
 
 		 788 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  40.95 
 
 		 788 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  38.47 
 
 		 575 aa  360  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  39.87 
 
 		 776 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  37.44 
 
 		 545 aa  356  5.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  38.37 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  39.76 
 
 		 574 aa  355  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  37.5 
 
 		 583 aa  352  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  35.96 
 
 		 603 aa  349  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  35.53 
 
 		 547 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  41.16 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  35.99 
 
 		 375 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  33.86 
 
 		 323 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  42.34 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0674  hypothetical protein  93.33 
 
 		 47 aa  87.4  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.45 
 
 		 1015 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  34.26 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.62 
 
 		 1041 aa  80.9  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  35.29 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1459 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  33.5 
 
 		 763 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.18 
 
 		 1107 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1495 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1497 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1631 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1376 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1473 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  26.05 
 
 		 1634 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1498 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1611 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1473 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1498 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  35.86 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1640 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  25.13 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1496 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1395 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  26.91 
 
 		 1439 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.62 
 
 		 863 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 1494 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1508 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  24.62 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  33.77 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1481 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  30.79 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1439 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.53 
 
 		 1263 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2764  hypothetical protein  33.12 
 
 		 410 aa  54.7  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00341411  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1481 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.56 
 
 		 713 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 		 475 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  22.36 
 
 		 379 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 421 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 447 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  30 
 
 		 499 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  34.85 
 
 		 565 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 		 437 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 		 437 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.22 
 
 		 937 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.22 
 
 		 937 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.76 
 
 		 476 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 437 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1744 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.87 
 
 		 242 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.22 
 
 		 867 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  28.83 
 
 		 1984 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1395 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1393 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  24.45 
 
 		 484 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1275 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.33 
 
 		 354 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 		 460 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 432 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  31.05 
 
 		 535 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.37 
 
 		 307 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  35.71 
 
 		 692 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  27.82 
 
 		 479 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1847 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 444 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  29.41 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 439 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.92 
 
 		 508 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  28.39 
 
 		 1990 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  29.59 
 
 		 413 aa  45.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 464 aa  44.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 444 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>