152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1257 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  76.49 
 
 		 788 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  76.1 
 
 		 788 aa  1151    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  76.1 
 
 		 788 aa  1152    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  100 
 
 		 776 aa  1571    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  41.56 
 
 		 731 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  41.43 
 
 		 755 aa  532  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  41.43 
 
 		 755 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  41.5 
 
 		 755 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  40.26 
 
 		 765 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  36.34 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  41.55 
 
 		 565 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  41.6 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  41.24 
 
 		 615 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  41.48 
 
 		 568 aa  365  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  40.92 
 
 		 545 aa  355  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  40.53 
 
 		 547 aa  353  5e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  39.55 
 
 		 622 aa  349  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  40.04 
 
 		 575 aa  347  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  44.34 
 
 		 443 aa  346  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  36.2 
 
 		 603 aa  342  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1126  secreted effector protein  75.22 
 
 		 322 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1092  secreted effector protein  73.45 
 
 		 322 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  47.15 
 
 		 581 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  36.84 
 
 		 388 aa  153  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  38.7 
 
 		 763 aa  144  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  45.9 
 
 		 301 aa  133  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  43.68 
 
 		 318 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  40.33 
 
 		 1041 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  39.6 
 
 		 863 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  42.56 
 
 		 284 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  43.84 
 
 		 375 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.94 
 
 		 1015 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.36 
 
 		 867 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1393 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.31 
 
 		 482 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  36.66 
 
 		 508 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1459 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  32.78 
 
 		 323 aa  90.9  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35 
 
 		 892 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1611 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1395 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  33.66 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1439 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.69 
 
 		 1107 aa  80.9  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  36.28 
 
 		 354 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1494 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  26.17 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  25.83 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1376 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.33 
 
 		 1263 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  25.83 
 
 		 379 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1439 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  38.06 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  31.4 
 
 		 1395 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1497 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  31.48 
 
 		 565 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1473 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1495 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  35.13 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  32.72 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.63 
 
 		 937 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  28.97 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.63 
 
 		 937 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  34.84 
 
 		 1024 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  31.4 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  36.72 
 
 		 886 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1389 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1473 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1498 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1508 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  30.52 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1498 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  38.14 
 
 		 761 aa  61.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  39.04 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 		 414 aa  60.1  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1496 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  30.48 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  34.06 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1744 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1351 aa  58.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  34.66 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.08 
 
 		 713 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  27.07 
 
 		 350 aa  56.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  31.07 
 
 		 2491 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.38 
 
 		 396 aa  55.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 		 475 aa  55.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  24.43 
 
 		 1344 aa  54.7  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 		 440 aa  54.7  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  36.84 
 
 		 490 aa  54.3  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  33.76 
 
 		 447 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 		 447 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  33.71 
 
 		 499 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.08 
 
 		 307 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  30.89 
 
 		 296 aa  51.6  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  27.91 
 
 		 523 aa  51.6  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 		 451 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.22 
 
 		 436 aa  50.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  36.77 
 
 		 446 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 		 441 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.45 
 
 		 1749 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>